More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0493 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0493  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 222 aa  436  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0117598 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  53.61 
 
 		 217 aa  177  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2189  transcriptional regulator, TetR family  47.72 
 
 		 202 aa  155  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2598  hypothetical protein  53.23 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 193 aa  121  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 197 aa  99  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 198 aa  94.7  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 196 aa  94.4  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 216 aa  92.8  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 204 aa  92.4  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 198 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  33.84 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3975  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4123  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 192 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 226 aa  88.6  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0252  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 194 aa  89  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.867584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 205 aa  88.6  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 200 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  34.55 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  32.29 
 
 		 198 aa  86.3  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4357  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 201 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  32.64 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4679  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.136213 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6901  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165859 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3212  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 193 aa  81.3  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 195 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08040  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4180  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0804485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6698  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2729  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0143  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4571  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4611  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 371 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3046  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2762  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 203 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3535  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1179  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288888  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3244  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1395  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3140  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.263348  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1418  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2964  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0240167  normal  0.157932 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6374  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007954  Sden_1229  regulatory protein, TetR  30.59 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 191 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 194 aa  74.7  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0839  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003910  CPS_1681  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1088  transcriptional regulator, TetR family protein  28.73 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_0716  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0418191  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008044  TM1040_0319  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_2694  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357406 
 
 
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NC_012850  Rleg_0959  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783426  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
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NC_008062  Bcen_6453  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6688  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6285  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42646  normal  1 
 
 
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