246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2210 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2210  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  354  3.9999999999999996e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124978  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0588  hypothetical protein  61.4 
 
 		 194 aa  191  5e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1828  hypothetical protein  54.94 
 
 		 198 aa  175  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.58144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  36.28 
 
 		 624 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05260  small-conductance mechanosensitive channel  27.91 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000774964  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  33.02 
 
 		 370 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  38.24 
 
 		 633 aa  57  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  43.04 
 
 		 627 aa  57  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  39.29 
 
 		 624 aa  57  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  38.46 
 
 		 682 aa  55.5  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0332  MscS Mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 773 aa  55.1  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.323369  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  30.88 
 
 		 288 aa  55.1  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  41.77 
 
 		 627 aa  55.1  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  41.77 
 
 		 627 aa  54.7  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  32.67 
 
 		 344 aa  54.7  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5463  MscS Mechanosensitive ion channel  33.56 
 
 		 343 aa  54.3  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1486  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 272 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  34.09 
 
 		 360 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  27.85 
 
 		 280 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  42.86 
 
 		 261 aa  53.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  33.62 
 
 		 373 aa  53.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  36.47 
 
 		 295 aa  52.8  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 327 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 327 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 327 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  36.67 
 
 		 335 aa  52  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  34.52 
 
 		 454 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 285 aa  52  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  33.63 
 
 		 336 aa  52  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0432  small-conductance mechanosensitive channel  31.13 
 
 		 298 aa  52  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000493882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 344 aa  51.6  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2167  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 228 aa  51.2  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000258413 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1398  MscS Mechanosensitive ion channel  34.31 
 
 		 266 aa  51.2  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  30.51 
 
 		 550 aa  50.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2413  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 221 aa  50.8  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0138474  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0104  hypothetical protein  30.21 
 
 		 280 aa  50.4  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0511133  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  32.29 
 
 		 342 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  32.31 
 
 		 297 aa  50.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 		 359 aa  50.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  30.49 
 
 		 372 aa  50.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 		 360 aa  50.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 325 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  33.33 
 
 		 366 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  33.79 
 
 		 806 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  31.65 
 
 		 288 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0571  MscS Mechanosensitive ion channel  25.83 
 
 		 260 aa  50.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000639441  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  26.35 
 
 		 278 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0190  small-conductance mechanosensitive channel  29.37 
 
 		 263 aa  50.1  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  42.37 
 
 		 286 aa  49.7  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461855 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  32.18 
 
 		 637 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  29.37 
 
 		 528 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1640  mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0204845  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  29.37 
 
 		 528 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  27.92 
 
 		 173 aa  49.7  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 435 aa  49.3  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 356 aa  49.3  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  26.9 
 
 		 282 aa  49.3  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2715  small-conductance mechanosensitive channel  26.87 
 
 		 270 aa  48.9  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0108  MscS mechanosensitive ion channel  22.84 
 
 		 291 aa  48.9  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 442 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  27.78 
 
 		 328 aa  48.9  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4090  MscS mechanosensitive ion channel  24.84 
 
 		 349 aa  48.9  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  36.25 
 
 		 794 aa  48.9  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1627  MscS mechanosensitive ion channel  39.68 
 
 		 881 aa  48.9  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  34.78 
 
 		 336 aa  48.9  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  29.68 
 
 		 280 aa  48.9  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  28.47 
 
 		 393 aa  48.5  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  36.14 
 
 		 911 aa  48.5  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  26.71 
 
 		 341 aa  48.5  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  29.56 
 
 		 362 aa  48.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0330  hypothetical protein  28.28 
 
 		 287 aa  48.1  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  25 
 
 		 351 aa  48.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1106  small-conductance mechanosensitive channel  28.47 
 
 		 265 aa  48.1  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1824  MscS Mechanosensitive ion channel  31.11 
 
 		 330 aa  48.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000045049  normal  0.0757476 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  27.14 
 
 		 283 aa  48.1  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  28.26 
 
 		 549 aa  47.8  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1443  MscS Mechanosensitive ion channel  34.94 
 
 		 311 aa  47.8  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  35.53 
 
 		 595 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  26.39 
 
 		 289 aa  47.8  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  29.77 
 
 		 292 aa  47.8  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  39.24 
 
 		 350 aa  47.4  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4427  MscS Mechanosensitive ion channel  23.64 
 
 		 349 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0238849  normal  0.125106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  32 
 
 		 337 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  22.54 
 
 		 299 aa  47.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  32.53 
 
 		 273 aa  47.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  32.88 
 
 		 693 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  27.54 
 
 		 298 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4819  MscS mechanosensitive ion channel  33.04 
 
 		 392 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  30.86 
 
 		 294 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13183  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  31.94 
 
 		 316 aa  47.4  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  33.56 
 
 		 414 aa  47  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2128  MscS mechanosensitive ion channel  23.31 
 
 		 270 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0039  hypothetical protein  22.97 
 
 		 291 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5772  MscS mechanosensitive ion channel  26.47 
 
 		 705 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429261  normal  0.122613 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  29.53 
 
 		 840 aa  46.6  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6057  MscS Mechanosensitive ion channel  35.71 
 
 		 779 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09010  small-conductance mechanosensitive channel  34.38 
 
 		 298 aa  47  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0427247  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5651  hypothetical protein  27.81 
 
 		 283 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>