More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4254 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  100 
 
 
149 aa  298  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  47.3 
 
 
142 aa  141  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  43.24 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  45.95 
 
 
144 aa  121  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  44.97 
 
 
145 aa  118  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  44.3 
 
 
144 aa  118  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  46.94 
 
 
142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  42.76 
 
 
144 aa  116  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  43.84 
 
 
138 aa  116  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  41.89 
 
 
140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  42.47 
 
 
138 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  43.24 
 
 
141 aa  108  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  38.93 
 
 
142 aa  106  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  36.81 
 
 
138 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  38 
 
 
145 aa  101  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  39.86 
 
 
150 aa  100  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  41.45 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  39.04 
 
 
140 aa  97.8  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  39.86 
 
 
139 aa  97.1  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  38.78 
 
 
137 aa  96.7  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  38.51 
 
 
139 aa  94.7  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1980  UspA domain protein  38.99 
 
 
150 aa  94.7  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  0.0911055 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  39.73 
 
 
136 aa  94.4  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  36.77 
 
 
145 aa  94.4  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  38.96 
 
 
295 aa  93.6  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  39.33 
 
 
141 aa  92.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  35.37 
 
 
176 aa  88.6  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1524  UspA domain protein  38.78 
 
 
143 aa  87.4  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0456308  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0904  UspA domain protein  39.49 
 
 
151 aa  87  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.633765  normal  0.56793 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2057  UspA domain protein  36.84 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  38.51 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1734  UspA domain protein  40 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  38.67 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  42.11 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  37.66 
 
 
180 aa  82  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1243  UspA domain protein  34.46 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  36.31 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  41.18 
 
 
158 aa  80.5  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  38.93 
 
 
288 aa  80.1  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  33.77 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  35.14 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  31.48 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  35.9 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  35.71 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  34.19 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  40.13 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  37.16 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  37.16 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  35.29 
 
 
157 aa  77  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 
143 aa  77  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  36.65 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  34.9 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  37.84 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  34.9 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  36.24 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  37.75 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  39.33 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.79 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  34.9 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  36.42 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  35.06 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  35.06 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  32.03 
 
 
164 aa  73.6  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  35.53 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  32.03 
 
 
449 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  39.33 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  36.84 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  34.87 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  38.26 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  35.53 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  31.08 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.67 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  38.82 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  37.91 
 
 
145 aa  72  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  35 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  34.44 
 
 
153 aa  72  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  34.67 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  38.26 
 
 
290 aa  71.2  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  32.21 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  34.19 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  35.14 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  36.18 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  35.81 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  35.81 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0528  UspA domain protein  34.19 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.572687  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  33.33 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  34.23 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  34.67 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  30.67 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  30.32 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  32.47 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  37.33 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  32.65 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  34.21 
 
 
307 aa  68.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  28.48 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  32.5 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0515  universal stress protein  33.77 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0014722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>