More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1913 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 497 aa  1007    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1757  replication factor C large subunit  66.33 
 
 		 497 aa  668    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0412755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  82.46 
 
 		 514 aa  835    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  62.11 
 
 		 507 aa  628  1e-179  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1810  replication factor C large subunit  59.61 
 
 		 500 aa  538  9.999999999999999e-153  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  44.26 
 
 		 467 aa  382  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  43.21 
 
 		 642 aa  375  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  39.8 
 
 		 497 aa  365  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  37.71 
 
 		 483 aa  294  3e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1352  replication factor C large subunit  40 
 
 		 484 aa  287  2e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  40.37 
 
 		 481 aa  286  7e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0629  replication factor C large subunit  39.75 
 
 		 484 aa  286  8e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1324  replication factor C large subunit  39.51 
 
 		 482 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.414275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  36.9 
 
 		 476 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  38.19 
 
 		 492 aa  281  2e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  41.01 
 
 		 454 aa  278  1e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  37.99 
 
 		 474 aa  276  4e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  38.84 
 
 		 451 aa  271  2e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  35.15 
 
 		 437 aa  255  1.0000000000000001e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  33.93 
 
 		 413 aa  231  2e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  31.57 
 
 		 423 aa  206  7e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  34.46 
 
 		 418 aa  204  4e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0004  replication factor C large subunit  31.9 
 
 		 421 aa  199  7.999999999999999e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  30.81 
 
 		 422 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2009  replication factor C large subunit  32.33 
 
 		 422 aa  193  6e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  30.36 
 
 		 443 aa  185  2.0000000000000003e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1828  AAA ATPase central domain protein  31.41 
 
 		 405 aa  178  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0627242  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0270  ATPase central domain-containing protein  26.21 
 
 		 385 aa  149  9e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022175 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00420  sister chromatid cohesion-related protein, putative  25.6 
 
 		 892 aa  120  7.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30204  predicted protein  27.24 
 
 		 498 aa  115  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  33.93 
 
 		 320 aa  113  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  33.49 
 
 		 289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  37.1 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  30.96 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  33.18 
 
 		 324 aa  110  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06303  Replication factor C like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78622]  30.26 
 
 		 1092 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  31.58 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  30.47 
 
 		 398 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  33.18 
 
 		 322 aa  107  6e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  31.84 
 
 		 319 aa  105  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  32.42 
 
 		 330 aa  104  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  32.08 
 
 		 329 aa  104  4e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  32.55 
 
 		 326 aa  104  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  33.5 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  32.08 
 
 		 328 aa  103  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  31.58 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  33.18 
 
 		 334 aa  102  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  30.67 
 
 		 315 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01320  purine nucleotide binding protein, putative  25.28 
 
 		 1001 aa  101  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  31.6 
 
 		 329 aa  101  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  31.36 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  30.22 
 
 		 315 aa  100  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  30.22 
 
 		 315 aa  100  7e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  30 
 
 		 325 aa  99.8  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  29.96 
 
 		 321 aa  97.8  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  30.58 
 
 		 326 aa  97.1  7e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  29.38 
 
 		 315 aa  95.5  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  32.87 
 
 		 327 aa  94  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  29.72 
 
 		 373 aa  92.8  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35815  predicted protein  25.75 
 
 		 764 aa  92  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.756935 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43994  predicted protein  27.67 
 
 		 942 aa  92  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  30.62 
 
 		 334 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  31.43 
 
 		 322 aa  90.5  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  30.14 
 
 		 341 aa  89.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  31.07 
 
 		 322 aa  89.7  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  29.33 
 
 		 322 aa  88.6  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  30.43 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  29.91 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  28.5 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  29.19 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  28.24 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  29.73 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  30.19 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  27.78 
 
 		 317 aa  79.7  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  26.98 
 
 		 342 aa  79.7  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  26.67 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  27.8 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  31.98 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48947  predicted protein  23.08 
 
 		 725 aa  77.4  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00599657 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  26.94 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  29.39 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1125  AAA ATPase central domain protein  26.43 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00180693  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.53 
 
 		 517 aa  70.1  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  34.55 
 
 		 940 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0815  AAA ATPase central domain protein  25 
 
 		 395 aa  66.6  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0991  recombination factor protein RarA  25.33 
 
 		 429 aa  66.2  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000017106  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06694  Chromosome transmission fidelity protein 18 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C1D3]  23.68 
 
 		 993 aa  65.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0563098 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33013  predicted protein  21.22 
 
 		 571 aa  65.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0011992  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.41 
 
 		 501 aa  64.7  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  26.15 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1935  recombination factor protein RarA  28.85 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0363606  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2501  recombination factor protein RarA  23.85 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41967  predicted protein  28.19 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.296814  normal  0.0690197 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0211  recombination factor protein RarA  24.19 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  26.43 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4294  recombination factor protein RarA  25.96 
 
 		 428 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4131  recombination factor protein RarA  25.84 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013957  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4628  recombination factor protein RarA  25.96 
 
 		 428 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00879535  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4482  recombination factor protein RarA  25.24 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.274389  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4519  recombination factor protein RarA  25.84 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.002942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>