More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_07840 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  51.77 
 
 
732 aa  726    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  51.67 
 
 
658 aa  671    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  57.45 
 
 
692 aa  769    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  57.61 
 
 
883 aa  667    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  50.48 
 
 
720 aa  708    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  60.65 
 
 
822 aa  709    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  53.61 
 
 
686 aa  708    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  58.28 
 
 
924 aa  677    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  58.04 
 
 
1035 aa  639    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  52.89 
 
 
686 aa  702    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  53.32 
 
 
686 aa  706    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  53.32 
 
 
686 aa  706    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  61.42 
 
 
971 aa  722    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  57.83 
 
 
888 aa  706    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  53.61 
 
 
686 aa  709    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  54.36 
 
 
673 aa  721    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0993  translation initiation factor IF-2  50.14 
 
 
668 aa  679    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000676499  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  52.95 
 
 
688 aa  702    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  56.65 
 
 
947 aa  658    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  52.72 
 
 
892 aa  637    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  51.4 
 
 
711 aa  653    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  53.88 
 
 
689 aa  714    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  48.8 
 
 
752 aa  654    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  54.71 
 
 
884 aa  666    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  56.14 
 
 
1161 aa  658    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  52.89 
 
 
686 aa  702    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  53.99 
 
 
898 aa  637    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  57.6 
 
 
903 aa  743    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  60 
 
 
739 aa  717    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  56.35 
 
 
980 aa  652    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1132  translation initiation factor IF-2  55.46 
 
 
738 aa  645    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00703147  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  50.3 
 
 
907 aa  642    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  51.49 
 
 
705 aa  696    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  52.96 
 
 
688 aa  698    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  58.45 
 
 
1131 aa  645    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  51.86 
 
 
689 aa  670    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  56.4 
 
 
679 aa  751    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  56.4 
 
 
679 aa  751    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  54.34 
 
 
920 aa  647    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  58.16 
 
 
1029 aa  739    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  59.11 
 
 
860 aa  681    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2091  translation initiation factor IF-2  53.05 
 
 
1005 aa  645    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596015  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  57.12 
 
 
882 aa  707    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  100 
 
 
686 aa  1374    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  53.18 
 
 
686 aa  702    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  57.04 
 
 
986 aa  659    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  56.29 
 
 
985 aa  711    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  57.34 
 
 
845 aa  658    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  55.9 
 
 
962 aa  652    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  51.49 
 
 
705 aa  696    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  55.71 
 
 
921 aa  650    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3751  translation initiation factor IF-2  54.95 
 
 
729 aa  641    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00372327  unclonable  0.0000243777 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  53.99 
 
 
882 aa  659    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  55.27 
 
 
945 aa  641    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  51.75 
 
 
885 aa  632  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  54.52 
 
 
1022 aa  629  1e-179  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  55.09 
 
 
854 aa  630  1e-179  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  53.25 
 
 
894 aa  630  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  53.07 
 
 
896 aa  627  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  54.97 
 
 
949 aa  627  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  54.15 
 
 
997 aa  627  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01335  putative translation initiation factor  52.15 
 
 
943 aa  627  1e-178  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09360  translation initiation factor IF-2  55.24 
 
 
941 aa  628  1e-178  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912391  normal  0.894138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0476  translation initiation factor IF-2  53.61 
 
 
602 aa  626  1e-178  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258534  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  48.24 
 
 
881 aa  625  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  53.31 
 
 
882 aa  626  1e-178  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  52.15 
 
 
964 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  48.51 
 
 
895 aa  627  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  49.24 
 
 
902 aa  622  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  49.84 
 
 
889 aa  622  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  48.55 
 
 
880 aa  623  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  54.34 
 
 
904 aa  624  1e-177  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  53.23 
 
 
984 aa  624  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  52.05 
 
 
891 aa  623  1e-177  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  51.99 
 
 
964 aa  624  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  48.86 
 
 
880 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08040  translation initiation factor IF-2  55.38 
 
 
929 aa  624  1e-177  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13732  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  48.86 
 
 
880 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  48.86 
 
 
880 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  48.86 
 
 
880 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  54.53 
 
 
968 aa  622  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0255  translation initiation factor IF-2  54.48 
 
 
979 aa  620  1e-176  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  54.28 
 
 
975 aa  621  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  48.48 
 
 
885 aa  619  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  54.28 
 
 
975 aa  621  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  54.11 
 
 
975 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2020  translation initiation factor IF-2  51.69 
 
 
1030 aa  621  1e-176  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  52.74 
 
 
894 aa  618  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  56.94 
 
 
928 aa  621  1e-176  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  48.55 
 
 
884 aa  619  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  54.11 
 
 
975 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  54.44 
 
 
979 aa  619  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  54.51 
 
 
948 aa  619  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  52.1 
 
 
956 aa  619  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  54.28 
 
 
975 aa  621  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  52.91 
 
 
896 aa  620  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  48.48 
 
 
889 aa  619  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  52.65 
 
 
882 aa  620  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  54.11 
 
 
975 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  52.98 
 
 
1079 aa  619  1e-176  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>