187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6153 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  100 
 
 		 397 aa  813    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  28.81 
 
 		 407 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  28.81 
 
 		 407 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  29.24 
 
 		 411 aa  113  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  29.93 
 
 		 413 aa  110  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  30.81 
 
 		 425 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  30.23 
 
 		 914 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  30.23 
 
 		 900 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  26.84 
 
 		 891 aa  99.8  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  29.9 
 
 		 900 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  30.49 
 
 		 756 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  31.98 
 
 		 399 aa  94  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  26.21 
 
 		 924 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.35 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  26.08 
 
 		 926 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  26.34 
 
 		 409 aa  90.9  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  26.75 
 
 		 894 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  26.09 
 
 		 904 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  26.61 
 
 		 896 aa  89.4  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  26.09 
 
 		 904 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  25.44 
 
 		 912 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  26.65 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  24.61 
 
 		 437 aa  86.7  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  26.46 
 
 		 428 aa  84  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  29.85 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.82 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  28.34 
 
 		 432 aa  80.5  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.57 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  27.67 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  27.52 
 
 		 405 aa  76.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  28.74 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  25.51 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0177  hypothetical protein  25.82 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.51 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.11 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  28.47 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.05 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  23.9 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.86 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  23.66 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03057  hypothetical protein  27.81 
 
 		 449 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3469  hypothetical protein  26.4 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  26.95 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.14 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  28.66 
 
 		 543 aa  64.3  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  23.38 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14410  carbamoylphosphate synthase large subunit  28.57 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3242  hypothetical protein  25.62 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  26.44 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  28.66 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  26.17 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.98 
 
 		 723 aa  60.5  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  25.32 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  26.51 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  24.09 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.08 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  25.1 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  24.67 
 
 		 406 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  24.67 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  24.67 
 
 		 406 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  26.79 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  26.79 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  26.54 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0072  hypothetical protein  25 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  29.57 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4142  hypothetical protein  25 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16964  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0721  hypothetical protein  28.81 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.34 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  25.36 
 
 		 395 aa  53.5  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2023  hypothetical protein  25.38 
 
 		 408 aa  53.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3091  PvsA  28.24 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4090  hypothetical protein  24.62 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.572464  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1612  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  25.84 
 
 		 1084 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225246  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6391  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.47 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782672  normal  0.167257 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  24.37 
 
 		 420 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1018  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.4 
 
 		 1087 aa  51.6  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0916  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  25.76 
 
 		 1038 aa  51.2  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.150361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1007  hypothetical protein  26.75 
 
 		 427 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  26.23 
 
 		 424 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0833  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.96 
 
 		 1086 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00324716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3748  protein of unknown function DUF201  25.08 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.69 
 
 		 403 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.69 
 
 		 403 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  26.43 
 
 		 409 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1852  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.72 
 
 		 1072 aa  49.7  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2678  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  25.31 
 
 		 1067 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2550  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  25.31 
 
 		 1067 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2822  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.37 
 
 		 1091 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2431  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.92 
 
 		 1143 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.133132  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2175  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.81 
 
 		 1082 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.321083  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2728  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.97 
 
 		 1077 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.523784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  27.8 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8363  putative siderophore biosynthesis protein  28.49 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  25.35 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0438  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.79 
 
 		 1110 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2193  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.62 
 
 		 1082 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442347  normal  0.129534 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2138  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.77 
 
 		 1085 aa  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0923584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.02 
 
 		 423 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0879  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.46 
 
 		 1070 aa  47.8  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2713  biotin carboxylase  25.4 
 
 		 260 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>