More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5463 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5463  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 343 aa  677    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2049  mechanosensitive ion channel  48.23 
 
 		 291 aa  258  8e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.492316  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02267  hypothetical protein  46.95 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1524  mechanosensitive ion channel  47.22 
 
 		 291 aa  252  5.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.288114  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  42 
 
 		 373 aa  189  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2895  helix-turn-helix, AraC type  40.23 
 
 		 264 aa  189  8e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2780  hypothetical protein  37.61 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188886  normal  0.0383383 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0330  hypothetical protein  38.1 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2715  small-conductance mechanosensitive channel  37.56 
 
 		 270 aa  155  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0108  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0987  MscS Mechanosensitive ion channel  38.66 
 
 		 238 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1093  MscS mechanosensitive ion channel  30.68 
 
 		 271 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.746887  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0849  MscS mechanosensitive ion channel  32.87 
 
 		 270 aa  125  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.925309  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1914  MscS mechanosensitive ion channel  31.62 
 
 		 275 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1137  MscS Mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 		 276 aa  123  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.463886 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2830  MscS mechanosensitive ion channel  28.97 
 
 		 269 aa  109  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  34.31 
 
 		 291 aa  94.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  29.44 
 
 		 1120 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  29.44 
 
 		 1120 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  29.44 
 
 		 1118 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  29.44 
 
 		 1118 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  29.44 
 
 		 1118 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  32.18 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  26.42 
 
 		 1115 aa  87.4  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  28.43 
 
 		 1120 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  28.43 
 
 		 1120 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1120 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  28.43 
 
 		 1120 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  25.87 
 
 		 1120 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  28.43 
 
 		 1120 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  25.87 
 
 		 1120 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  25.87 
 
 		 1120 aa  86.7  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  28.43 
 
 		 1118 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  30.13 
 
 		 362 aa  86.3  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1139  MscS Mechanosensitive ion channel  27.13 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.471247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  29.45 
 
 		 1117 aa  82.8  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  29.49 
 
 		 362 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  32.16 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  28.02 
 
 		 806 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2565  hypothetical protein  29.2 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6057  MscS Mechanosensitive ion channel  24.22 
 
 		 779 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  29.75 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  30.22 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4521  MscS Mechanosensitive ion channel  31.09 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  27.22 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  30.46 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  25 
 
 		 1144 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  25.73 
 
 		 830 aa  78.2  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  25.56 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  24.32 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 		 685 aa  77.8  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  24.74 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  35.25 
 
 		 637 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 435 aa  76.3  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3321  MscS mechanosensitive ion channel  27.08 
 
 		 1078 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.660513  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  24.51 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  27.08 
 
 		 1080 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  26.64 
 
 		 1120 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  26.64 
 
 		 1120 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1435  hypothetical protein  32.08 
 
 		 983 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  26.64 
 
 		 1120 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  28.92 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  24.36 
 
 		 1166 aa  74.7  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  25.57 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  35.24 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  31.28 
 
 		 544 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  25.69 
 
 		 1067 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3071  hypothetical protein  27.45 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.962312  normal  0.378174 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  30.82 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0587  MscS mechanosensitive ion channel  25.69 
 
 		 1067 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0226105 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  25.69 
 
 		 1067 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0586  MscS mechanosensitive ion channel  25.69 
 
 		 1067 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0875624 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  37.72 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  25.69 
 
 		 1067 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3551  MscS mechanosensitive ion channel  24.46 
 
 		 1062 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  25.69 
 
 		 1072 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  26.61 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4182  MscS mechanosensitive ion channel  24.59 
 
 		 1070 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  25.69 
 
 		 1072 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5470  MscS mechanosensitive ion channel  25.1 
 
 		 835 aa  73.6  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3291  MscS mechanosensitive ion channel  25.69 
 
 		 1068 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.563171  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  25.69 
 
 		 1072 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  35.09 
 
 		 426 aa  73.6  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5759  potassium efflux protein KefA  27.17 
 
 		 1118 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738971  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  28.41 
 
 		 874 aa  73.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0786  MscS mechanosensitive ion channel  25.69 
 
 		 1066 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.213544  hitchhiker  0.000495101 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1549  hypothetical protein  31.85 
 
 		 983 aa  73.2  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3656  MscS mechanosensitive ion channel  25.09 
 
 		 856 aa  73.2  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.570339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  32.07 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461855 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66400  potassium efflux protein KefA  27.17 
 
 		 1118 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  33.61 
 
 		 393 aa  72.8  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.32 
 
 		 507 aa  72.8  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  27.97 
 
 		 636 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3392  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 833 aa  72.4  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2128  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  26.91 
 
 		 289 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  26.6 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>