83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2932 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2932  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 309 aa  594  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  26.37 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  25.89 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2336  polysaccharide deacetylase  28.31 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  30.61 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  30.95 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  31.5 
 
 		 347 aa  65.9  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  30.95 
 
 		 398 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1279  polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 348 aa  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26869  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  21.75 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  30.58 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5866  polysaccharide deacetylase  35.77 
 
 		 350 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  26.95 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1635  polysaccharide deacetylase  32.69 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  28.33 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3984  polysaccharide deacetylase  26.92 
 
 		 322 aa  57  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  24.07 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1604  polysaccharide deacetylase  31.45 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 348 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.72 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1885  polysaccharide deacetylase  30.71 
 
 		 350 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  26.59 
 
 		 353 aa  53.9  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  30.68 
 
 		 322 aa  53.5  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 266 aa  53.1  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0752  putative polysaccharide deacetylase  32.97 
 
 		 352 aa  53.1  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  28.9 
 
 		 321 aa  52.8  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  40.24 
 
 		 270 aa  52.8  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0595  polysaccharide deacetylase  29.96 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  29.14 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.91 
 
 		 409 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  31.82 
 
 		 409 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  31.82 
 
 		 409 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  22.27 
 
 		 337 aa  50.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3472  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 409 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 409 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  30 
 
 		 409 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00128  hypothetical protein  30 
 
 		 409 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411127  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0138  polysaccharide deacetylase domain protein  30 
 
 		 409 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  38.46 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0306  polysaccharide deacetylase  34.55 
 
 		 353 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.957569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0148  polysaccharide deacetylase  25.45 
 
 		 342 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05320  Polysaccharide deacetylase  26.95 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354337  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04002  Polysaccharide deacetylase family protein  28.44 
 
 		 391 aa  47.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  28.49 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1027  hypothetical protein  27.8 
 
 		 349 aa  47  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504748  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0635  polysaccharide deacetylase  29.39 
 
 		 345 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  31.07 
 
 		 352 aa  46.6  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  29.46 
 
 		 275 aa  46.2  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 351 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  36 
 
 		 626 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  25.86 
 
 		 373 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0250  polysaccharide deacetylase  31.5 
 
 		 349 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28438  normal  0.993392 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  23.49 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0771  polysaccharide deacetylase  31.84 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  28.83 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1847  polysaccharide deacetylase  30.59 
 
 		 313 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1226  polysaccharide deacetylase  24.74 
 
 		 337 aa  44.3  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  25.65 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2923  polysaccharide deacetylase family protein  30 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4603  putative polysaccharide deacetylase  30.55 
 
 		 353 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3346  polysaccharide deacetylase family protein  25.93 
 
 		 417 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000257148  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1014  polysaccharide deacetylase family protein  25.93 
 
 		 417 aa  43.5  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3475  polysaccharide deacetylase  25.93 
 
 		 437 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1756  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2015  polysaccharide deacetylase  25.12 
 
 		 333 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0883  polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 		 352 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272059  normal  0.749815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8504  polysaccharide deacetylase  35.95 
 
 		 223 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.0143221 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  26.26 
 
 		 256 aa  43.1  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  26.74 
 
 		 672 aa  42.7  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 		 256 aa  42.7  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  29.59 
 
 		 314 aa  42.7  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 		 278 aa  42.7  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  31.48 
 
 		 373 aa  42.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 		 279 aa  42.7  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  26.88 
 
 		 305 aa  42.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4674  polysaccharide deacetylase  32.56 
 
 		 234 aa  42.7  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0213  polysaccharide deacetylase  28.7 
 
 		 407 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>