More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2031 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2031  peptide deformylase  100 
 
 		 166 aa  344  3e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00573318  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0438  polypeptide deformylase  60.12 
 
 		 167 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0600  peptide deformylase  60.12 
 
 		 167 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3495  peptide deformylase  50.61 
 
 		 177 aa  165  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3968  peptide deformylase  48.78 
 
 		 168 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00347079  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4054  peptide deformylase  48.17 
 
 		 168 aa  160  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3456  polypeptide deformylase  49.7 
 
 		 169 aa  154  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3553  formylmethionine deformylase  48.78 
 
 		 168 aa  153  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0187724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4385  peptide deformylase  48.17 
 
 		 168 aa  153  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.699073  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0528  peptide deformylase  48.48 
 
 		 169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2534  polypeptide deformylase  46.34 
 
 		 167 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3513  peptide deformylase  49.39 
 
 		 168 aa  149  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.145382  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0895  peptide deformylase  46.39 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00298433  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0492  peptide deformylase  43.48 
 
 		 164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  42.68 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2006  peptide deformylase  45.45 
 
 		 163 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0958745  hitchhiker  0.000967888 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  41.61 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  44.81 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  44.24 
 
 		 178 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2597  peptide deformylase  46.1 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.442514 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  42.21 
 
 		 169 aa  124  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  45.1 
 
 		 170 aa  124  7e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2319  peptide deformylase  44.81 
 
 		 163 aa  124  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000135964  normal  0.850535 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  41.72 
 
 		 170 aa  124  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  41.72 
 
 		 170 aa  124  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2530  peptide deformylase  44.16 
 
 		 163 aa  123  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1795  peptide deformylase  46.1 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.591266  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2142  peptide deformylase  44.81 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.644494 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2219  peptide deformylase  44.81 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.025374  normal  0.833863 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0075  peptide deformylase  44.17 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  41.1 
 
 		 178 aa  121  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  41.83 
 
 		 177 aa  121  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  42.58 
 
 		 177 aa  121  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2387  peptide deformylase  46.1 
 
 		 163 aa  121  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2023  peptide deformylase  45.45 
 
 		 163 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000549527  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2315  peptide deformylase  45.45 
 
 		 163 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000721135  hitchhiker  0.00567391 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2302  peptide deformylase  45.45 
 
 		 163 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0456744  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2071  peptide deformylase  45.45 
 
 		 163 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.0359728 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  42.48 
 
 		 169 aa  120  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  42.48 
 
 		 169 aa  120  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  42.48 
 
 		 169 aa  120  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  42.48 
 
 		 169 aa  120  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  42.48 
 
 		 169 aa  120  8e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  42.48 
 
 		 169 aa  120  8e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  42.48 
 
 		 169 aa  120  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  42.48 
 
 		 169 aa  120  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  42.86 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  42.48 
 
 		 169 aa  119  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  43.14 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  43.14 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  43.14 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1128  peptide deformylase  43.51 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000081593  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  41.72 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  39.87 
 
 		 185 aa  118  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  41.83 
 
 		 169 aa  119  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  42.33 
 
 		 172 aa  118  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  41.83 
 
 		 169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2103  peptide deformylase  43.14 
 
 		 163 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.614546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  42.77 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  41.83 
 
 		 169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  41.83 
 
 		 169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  41.83 
 
 		 169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  41.83 
 
 		 169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  41.98 
 
 		 173 aa  117  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000249  peptide deformylase  39.87 
 
 		 168 aa  117  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  42.48 
 
 		 169 aa  117  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  41.83 
 
 		 169 aa  117  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  42.33 
 
 		 172 aa  117  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  42.21 
 
 		 155 aa  117  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  43.4 
 
 		 156 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  41.32 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  39.87 
 
 		 170 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  46.1 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3910  peptide deformylase  42.77 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3608  peptide deformylase  42.77 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3626  peptide deformylase  42.77 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0022378  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3915  peptide deformylase  42.77 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0024  peptide deformylase  44.81 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  41.18 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1232  peptide deformylase  38.06 
 
 		 152 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000166478  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0031  peptide deformylase  43.51 
 
 		 199 aa  114  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  41.18 
 
 		 169 aa  114  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  42.48 
 
 		 167 aa  114  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0035  peptide deformylase  43.51 
 
 		 170 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0880297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  39.47 
 
 		 164 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  40.25 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  42.14 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  42.14 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0407  peptide deformylase  41.18 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447377  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  40.49 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  41.94 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  40.49 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  40.49 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  43.05 
 
 		 147 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3789  peptide deformylase  40.52 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.156401  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  39.88 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  40.62 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0017  peptide deformylase  40.91 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.746118  normal  0.214252 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  40.26 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  41.94 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>