291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0276 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0276  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 449 aa  890    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0967709  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00318  putative cation efflux protein  29 
 
 		 454 aa  159  9e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1929  outer membrane efflux protein  27.75 
 
 		 447 aa  147  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.845235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0134  outer membrane efflux protein  27.32 
 
 		 439 aa  143  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4856  putative cation efflux protein  25.42 
 
 		 496 aa  139  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001397  heavy metal RND efflux CzcC family  24.94 
 
 		 473 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06364  hypothetical protein  25.53 
 
 		 463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2434  outer membrane efflux protein  27.44 
 
 		 433 aa  123  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.990538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2062  outer membrane efflux protein  27.44 
 
 		 436 aa  122  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0170  outer membrane efflux protein  27.44 
 
 		 436 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2210  outer membrane efflux protein  27.78 
 
 		 420 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0896895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0475  putative outer membrane cation efflux protein  28.83 
 
 		 437 aa  121  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.668446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2394  outer membrane efflux protein  27.07 
 
 		 487 aa  120  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1807  cobalt-zinc-cadmium resistance outer membrane porin  28.36 
 
 		 433 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.804371 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1368  copper/silver resistance outer membrane protein  23.81 
 
 		 437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5357  outer membrane efflux protein  29.08 
 
 		 433 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0020  outer membrane efflux protein  29.33 
 
 		 417 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171536 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0020  outer membrane efflux protein  29.33 
 
 		 417 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0022  outer membrane efflux protein  29.33 
 
 		 417 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4013  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  30.75 
 
 		 414 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498662  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0716  hypothetical protein  23.78 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6134  proton antiporter metal efflux protein SilC  28.02 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2394  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  29.74 
 
 		 418 aa  106  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.794005  hitchhiker  0.00223071 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5385  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  31.76 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_003296  RS05407  putative outer membrane cation efflux protein  27.99 
 
 		 434 aa  106  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0176  outer membrane protein  26.03 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1388  outer membrane efflux protein  30.18 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615787 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1619  outer membrane efflux protein  26.17 
 
 		 427 aa  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.891221  hitchhiker  0.0000204841 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4511  outer membrane efflux protein  28.04 
 
 		 428 aa  103  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1949  outer membrane heavy metal efflux protein, putative  26.17 
 
 		 427 aa  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1528  Outer membrane efflux protein  26.65 
 
 		 501 aa  103  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3041  outer membrane efflux protein  29.5 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6284  outer membrane efflux protein  26.68 
 
 		 430 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524439  normal  0.254062 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3493  outer membrane efflux protein  27.72 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3073  outer membrane efflux protein  28.53 
 
 		 419 aa  100  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2326  outer membrane efflux protein  30.33 
 
 		 407 aa  97.4  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.347361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5031  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin CusC  28.28 
 
 		 433 aa  97.1  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.11545 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5289  outer membrane efflux protein  27.46 
 
 		 434 aa  96.7  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1648  outer membrane efflux protein  27.46 
 
 		 434 aa  96.7  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1261  outer membrane efflux protein  27.51 
 
 		 419 aa  96.3  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1625  putative outer membrane cation efflux protein  27.82 
 
 		 438 aa  93.6  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.164606 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3343  outer membrane efflux protein  25.44 
 
 		 412 aa  93.2  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2892  outer membrane efflux protein  29.44 
 
 		 419 aa  93.2  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5180  outer membrane efflux protein  25.13 
 
 		 430 aa  93.2  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5688  outer membrane efflux protein  26.68 
 
 		 430 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0325821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3400  outer membrane efflux protein  27.99 
 
 		 430 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4116  outer membrane efflux protein  27.99 
 
 		 430 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2548  outer membrane efflux protein  28.87 
 
 		 408 aa  91.7  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4767  outer membrane efflux protein  27.99 
 
 		 430 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  25 
 
 		 440 aa  91.7  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1335  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  26.74 
 
 		 429 aa  89.7  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  27.22 
 
 		 426 aa  87  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1155  hypothetical protein  26.36 
 
 		 418 aa  80.1  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 408 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2439  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  30.08 
 
 		 408 aa  76.3  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2050  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  28.82 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202753 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0863  outer membrane efflux protein  21.98 
 
 		 443 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6301  outer membrane efflux protein  30.28 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  27.25 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  27.79 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  26.33 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  26.33 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  26.33 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3374  outer membrane efflux protein  28.12 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2048  outer membrane efflux protein  28.12 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3044  outer membrane efflux protein  28.12 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2236  outer membrane efflux protein  28.12 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3364  outer membrane efflux protein  26.6 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0128671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  26.33 
 
 		 394 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  23.8 
 
 		 443 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0330  outer membrane efflux protein  27.56 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0512  outer membrane efflux protein  27.56 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0317  outer membrane efflux protein  27.84 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1408  Outer membrane efflux protein  24.23 
 
 		 466 aa  70.5  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.79 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  23.86 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1167  outer membrane efflux protein  25.31 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  22.71 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  24.93 
 
 		 479 aa  63.2  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  23.09 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1877  Outer membrane efflux protein  26.43 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  26.3 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2395  CzcC family heavy metal RND efflux outer membrane protein  27.9 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502937  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  23.91 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1099  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.83 
 
 		 460 aa  59.3  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  23.91 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1164  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.3 
 
 		 473 aa  58.9  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000188172  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.42 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  28.61 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0863  RND efflux system, drug efflux transporter, outer membrane lipoprotein  27.76 
 
 		 477 aa  58.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.353434  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  22.19 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0987  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.76 
 
 		 477 aa  58.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  28.61 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1554  outer membrane efflux protein  27.34 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  24.54 
 
 		 446 aa  57  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3306  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.25 
 
 		 474 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3490  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.42 
 
 		 503 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.350691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  29 
 
 		 417 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03275  putative cation efflux protein  36.59 
 
 		 117 aa  55.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2670  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.61 
 
 		 532 aa  55.1  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0133401  normal  0.268883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>