More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1757 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  66.33 
 
 		 497 aa  657    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1757  replication factor C large subunit  100 
 
 		 497 aa  1011    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0412755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  70.98 
 
 		 507 aa  734    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  71.89 
 
 		 514 aa  667    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1810  replication factor C large subunit  62.39 
 
 		 500 aa  567  1e-160  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  43.75 
 
 		 497 aa  394  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  45.31 
 
 		 467 aa  387  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  43.74 
 
 		 642 aa  375  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  38.07 
 
 		 483 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  41.16 
 
 		 451 aa  293  5e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  39.46 
 
 		 476 aa  291  3e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  40.43 
 
 		 454 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  39.14 
 
 		 481 aa  281  1e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1352  replication factor C large subunit  39.16 
 
 		 484 aa  278  2e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0629  replication factor C large subunit  38.42 
 
 		 484 aa  276  5e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  37.86 
 
 		 492 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1324  replication factor C large subunit  38.18 
 
 		 482 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.414275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  38.33 
 
 		 474 aa  272  9e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  39.36 
 
 		 437 aa  257  4e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  34.61 
 
 		 413 aa  231  3e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1828  AAA ATPase central domain protein  32.9 
 
 		 405 aa  179  8e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0627242  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  30.96 
 
 		 423 aa  179  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  30.2 
 
 		 422 aa  178  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  32.12 
 
 		 443 aa  178  3e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0004  replication factor C large subunit  30.79 
 
 		 421 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2009  replication factor C large subunit  31.23 
 
 		 422 aa  174  5e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  30.39 
 
 		 418 aa  173  5.999999999999999e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0270  ATPase central domain-containing protein  28.12 
 
 		 385 aa  137  4e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022175 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30204  predicted protein  27.97 
 
 		 498 aa  120  6e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01320  purine nucleotide binding protein, putative  28.3 
 
 		 1001 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  36.89 
 
 		 325 aa  107  4e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  31.96 
 
 		 320 aa  102  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06303  Replication factor C like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78622]  28.82 
 
 		 1092 aa  98.6  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00420  sister chromatid cohesion-related protein, putative  23.83 
 
 		 892 aa  99.4  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  31.05 
 
 		 324 aa  98.6  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  31.73 
 
 		 326 aa  99  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  31.07 
 
 		 326 aa  97.1  7e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  31.07 
 
 		 348 aa  96.7  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  30.77 
 
 		 329 aa  96.7  9e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  31.73 
 
 		 329 aa  96.3  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  32.21 
 
 		 319 aa  95.9  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  28.4 
 
 		 398 aa  95.9  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  31.25 
 
 		 328 aa  95.9  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  32.21 
 
 		 322 aa  94.7  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  29.09 
 
 		 322 aa  92.8  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  30.54 
 
 		 318 aa  92  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  31.75 
 
 		 334 aa  92.4  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  31.4 
 
 		 330 aa  91.3  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  28.64 
 
 		 347 aa  90.9  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  27.4 
 
 		 332 aa  90.5  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  28.18 
 
 		 289 aa  89.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  28.62 
 
 		 321 aa  88.6  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43994  predicted protein  28.95 
 
 		 942 aa  88.2  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  28.82 
 
 		 315 aa  87.4  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35815  predicted protein  25.84 
 
 		 764 aa  87.4  6e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.756935 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  28.82 
 
 		 315 aa  87.4  6e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  28.82 
 
 		 315 aa  87  7e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  29.47 
 
 		 349 aa  86.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  27.49 
 
 		 325 aa  85.9  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  28.85 
 
 		 341 aa  85.9  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  27.83 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  27.56 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  29.33 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  27.96 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  29.76 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  27.91 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  27.18 
 
 		 322 aa  79.7  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  30 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  26.7 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  28.57 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  28.36 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  26.32 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48947  predicted protein  24.56 
 
 		 725 aa  77.8  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00599657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  29.27 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  25.56 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  26.48 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  24.19 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  28.11 
 
 		 350 aa  72  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  28.1 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  27.8 
 
 		 317 aa  69.3  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  31.45 
 
 		 940 aa  67.8  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1125  AAA ATPase central domain protein  26.82 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00180693  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1935  recombination factor protein RarA  29.57 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0363606  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0211  recombination factor protein RarA  26.67 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  29.21 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33013  predicted protein  22.58 
 
 		 571 aa  63.5  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0011992  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06694  Chromosome transmission fidelity protein 18 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C1D3]  22.48 
 
 		 993 aa  62.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0563098 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2144  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.35 
 
 		 741 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4519  recombination factor protein RarA  25.96 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.002942  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1138  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.67 
 
 		 550 aa  61.2  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0257  recombination factor protein RarA  27.31 
 
 		 439 aa  59.7  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097809  normal  0.0366003 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  25.48 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  27.73 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45690  predicted protein  24.88 
 
 		 1015 aa  59.7  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0717  recombination factor protein RarA  25.48 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000773245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  28.44 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0815  AAA ATPase central domain protein  25 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4294  recombination factor protein RarA  25.48 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118829  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4628  recombination factor protein RarA  25.48 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00879535  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1978  recombination factor protein RarA  28.44 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>