164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3015 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_3015  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 416 aa  813    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  29.77 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  26.9 
 
 		 475 aa  79.7  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  31.25 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  30.04 
 
 		 463 aa  77.4  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  27.38 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  28.4 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  32.55 
 
 		 1454 aa  70.5  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  33.23 
 
 		 901 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  28.1 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.86 
 
 		 386 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  30.09 
 
 		 963 aa  67  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  30.16 
 
 		 450 aa  67  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.3 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  28.27 
 
 		 687 aa  64.3  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  28.51 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  27.52 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  24.32 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  26.52 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  28.11 
 
 		 705 aa  62  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.74 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 		 774 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  27.74 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.33 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1682 aa  60.1  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0619  Pyrrolo-quinoline quinone  25.96 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.051105  hitchhiker  0.000000261187 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.71 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1729  Pyrrolo-quinoline quinone  35.34 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.3 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  26.35 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  25.3 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  25.36 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.91 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  31.28 
 
 		 795 aa  57.4  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  28.29 
 
 		 514 aa  56.6  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  25.38 
 
 		 2122 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  27.4 
 
 		 371 aa  56.2  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.06 
 
 		 1383 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  26.99 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  22.9 
 
 		 445 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  26.84 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.17 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  23.72 
 
 		 422 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0513  Pyrrolo-quinoline quinone  26.67 
 
 		 422 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.83 
 
 		 395 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  25.83 
 
 		 395 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  33.5 
 
 		 423 aa  53.9  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  24.87 
 
 		 1241 aa  53.5  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  30.85 
 
 		 402 aa  53.5  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  27.68 
 
 		 653 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  24.59 
 
 		 371 aa  53.1  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  24.03 
 
 		 396 aa  53.1  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  24.47 
 
 		 1328 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  25.97 
 
 		 448 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  23.8 
 
 		 616 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  31.82 
 
 		 365 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  25.68 
 
 		 652 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.86 
 
 		 386 aa  52.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  29.31 
 
 		 484 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05030  predicted phosphohydrolase  32.86 
 
 		 726 aa  52.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  27.78 
 
 		 371 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0750  PQQ repeat-containing protein  20.06 
 
 		 353 aa  52  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.137969  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2204  Pyrrolo-quinoline quinone  26.95 
 
 		 444 aa  51.6  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  24.36 
 
 		 797 aa  51.6  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.53 
 
 		 392 aa  52.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2497  Pyrrolo-quinoline quinone  25.19 
 
 		 475 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1740  Pyrrolo-quinoline quinone  32.51 
 
 		 451 aa  51.2  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  25.97 
 
 		 454 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  24.24 
 
 		 322 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.27 
 
 		 411 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1209  WD40-like protein repeat-like protein  25.61 
 
 		 446 aa  50.8  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.415141  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 		 374 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  29.35 
 
 		 397 aa  50.8  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.8 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0160  Pyrrolo-quinoline quinone  28.3 
 
 		 471 aa  50.4  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0726185  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  27.01 
 
 		 372 aa  50.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  24.89 
 
 		 322 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  24.74 
 
 		 386 aa  50.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  27.21 
 
 		 454 aa  50.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.28 
 
 		 392 aa  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1144  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  28.68 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3125  Pyrrolo-quinoline quinone  25.64 
 
 		 444 aa  50.1  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  24.27 
 
 		 469 aa  50.1  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3733  Pyrrolo-quinoline quinone  29.63 
 
 		 562 aa  50.1  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  34.19 
 
 		 497 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000580169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.82 
 
 		 392 aa  48.9  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  27.5 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  22.5 
 
 		 1067 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  24.16 
 
 		 322 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1441  Pyrrolo-quinoline quinone  28.29 
 
 		 708 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121309 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.5 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.5 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  27.5 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3214  Pyrrolo-quinoline quinone  31.58 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000613548  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0598  Pyrrolo-quinoline quinone  27.4 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.118149  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.91 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.49 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.49 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.49 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.49 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>