215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1789 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1789  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  374  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  42.7 
 
 		 342 aa  75.9  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  44.16 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1251  XRE family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92911 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 351 aa  71.6  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  44.16 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  41.77 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  38.89 
 
 		 348 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  38.89 
 
 		 347 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1363  hypothetical protein  55 
 
 		 294 aa  67  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  28.33 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  28.33 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  24.57 
 
 		 350 aa  65.5  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  45.59 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0895  XRE family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000331112 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  45.59 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  50.77 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0882  helix-turn-helix domain-containing protein  40.79 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703197  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0852  Cro/CI family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  26.95 
 
 		 363 aa  62  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  26.95 
 
 		 345 aa  62  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  26.95 
 
 		 368 aa  62  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1714  hypothetical protein  48.48 
 
 		 288 aa  61.6  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333106  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  43.04 
 
 		 325 aa  61.2  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1778  hypothetical protein  48.48 
 
 		 288 aa  61.6  0.000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842722  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  36.54 
 
 		 286 aa  61.2  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  36.54 
 
 		 286 aa  61.2  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2193  hypothetical protein  30.66 
 
 		 380 aa  61.2  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  35.79 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  38.96 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  41.11 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1659  transcriptional regulator, XRE family  46.97 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4326  XRE family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 343 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137482  hitchhiker  0.0000000466309 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  29.93 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  30.83 
 
 		 380 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  29.13 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  30.25 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  33.61 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  28.08 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  30.83 
 
 		 376 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  30.83 
 
 		 375 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  32.8 
 
 		 321 aa  58.5  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  43.24 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  39.62 
 
 		 311 aa  58.2  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  33.33 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  27.91 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  27.74 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  33.64 
 
 		 362 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  30 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  30.83 
 
 		 340 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  38.36 
 
 		 360 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  39.74 
 
 		 340 aa  55.8  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  38.36 
 
 		 362 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  38.36 
 
 		 387 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  38.36 
 
 		 387 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  38.36 
 
 		 387 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1152  transcriptional regulator, XRE family  32.3 
 
 		 337 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.603159  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 314 aa  55.5  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  38.36 
 
 		 336 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  38.36 
 
 		 336 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2186  hypothetical protein  31.43 
 
 		 322 aa  55.1  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  33.88 
 
 		 336 aa  55.1  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  34.88 
 
 		 265 aa  55.1  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 285 aa  55.1  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2558  hypothetical protein  39.56 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  31.16 
 
 		 273 aa  54.7  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4253  hypothetical protein  31.2 
 
 		 330 aa  53.9  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  28.57 
 
 		 374 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  27.61 
 
 		 278 aa  53.9  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2654  hypothetical protein  44.74 
 
 		 143 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 342 aa  54.7  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  35.29 
 
 		 313 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02408  hypothetical protein  31.68 
 
 		 337 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2800  cytoskeletal protein RodZ  31.68 
 
 		 337 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.563257  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  28.8 
 
 		 323 aa  53.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  30.3 
 
 		 311 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3741  cytoskeletal protein RodZ  31.68 
 
 		 337 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2667  cytoskeletal protein RodZ  31.68 
 
 		 337 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  32 
 
 		 441 aa  53.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1302  hypothetical protein  45.59 
 
 		 142 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02370  hypothetical protein  31.68 
 
 		 337 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2891  cytoskeletal protein RodZ  31.68 
 
 		 337 aa  53.9  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  32.84 
 
 		 324 aa  53.9  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1161  cytoskeletal protein RodZ  31.68 
 
 		 337 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.697985  decreased coverage  0.00885076 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  27.97 
 
 		 308 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  41.18 
 
 		 336 aa  53.9  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2668  cytoskeletal protein RodZ  31.48 
 
 		 336 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.248516 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  28.68 
 
 		 303 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>