199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1458 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  100 
 
 
138 aa  275  1e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  41.13 
 
 
173 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  39.85 
 
 
179 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  40.37 
 
 
175 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  38.64 
 
 
160 aa  97.1  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  42.34 
 
 
178 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  36.92 
 
 
145 aa  95.1  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  39.37 
 
 
148 aa  94  6e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  36.3 
 
 
163 aa  94  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  38.53 
 
 
176 aa  93.6  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  36.61 
 
 
158 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  39.45 
 
 
172 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  41.13 
 
 
139 aa  91.3  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  36.11 
 
 
158 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  38.4 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  39.02 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0987  hypothetical protein  39.52 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  32.84 
 
 
162 aa  88.2  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  37.61 
 
 
319 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  38.58 
 
 
174 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0917  hypothetical protein  39.52 
 
 
139 aa  88.2  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000487122  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  34.59 
 
 
160 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  38.46 
 
 
151 aa  87.8  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  34.78 
 
 
160 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  34.78 
 
 
160 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  38.98 
 
 
318 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  35.4 
 
 
323 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  39.02 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  35.59 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3566  hypothetical protein  37.31 
 
 
159 aa  85.5  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000659278  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  37.61 
 
 
307 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  40.32 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  36.97 
 
 
357 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  34.75 
 
 
155 aa  84  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  36.13 
 
 
365 aa  84  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  37.61 
 
 
157 aa  84  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  37.31 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  35.83 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  37.82 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  37.74 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  37.93 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  36.92 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  31.03 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  32.39 
 
 
150 aa  83.6  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  36.45 
 
 
191 aa  82  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  31.03 
 
 
157 aa  82  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  37.93 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  42.42 
 
 
204 aa  82  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  35.48 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  36.21 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  35.24 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  35.65 
 
 
174 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  35.25 
 
 
159 aa  80.1  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  35.65 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  34.45 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  35.16 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  36.28 
 
 
357 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  36.04 
 
 
199 aa  78.2  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  34.07 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0817  D-alanine--D-alanine ligase  30.15 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000734111  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1972  protein of unknown function DUF461  32.56 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4714  hypothetical protein  33.08 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  33.33 
 
 
227 aa  77  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  34.68 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  38.61 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  33.33 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  32.31 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  32.65 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  35.14 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  43 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  31.4 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  33.86 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  32.59 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  35.66 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2850  hypothetical protein  32.35 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000551875  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  29.85 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  29.85 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  35.11 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  35.14 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  31.5 
 
 
159 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  34.78 
 
 
181 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  33.33 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4881  hypothetical protein  34.95 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  33.33 
 
 
351 aa  73.2  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  31.54 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  33.61 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  32.59 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  33.59 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  31.34 
 
 
149 aa  72  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  29.03 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  31.71 
 
 
320 aa  72  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  31.93 
 
 
149 aa  72  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5303  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0691155 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  31.3 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  36.97 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  30.7 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  32.11 
 
 
328 aa  71.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  35.35 
 
 
187 aa  72  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  32.85 
 
 
213 aa  71.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>