More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1153 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 352 aa  693    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  37.07 
 
 		 338 aa  210  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2357  hypothetical protein  42.58 
 
 		 348 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116724  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  43.56 
 
 		 348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000167428  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1210  MscS mechanosensitive ion channel  38.21 
 
 		 344 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  37.79 
 
 		 345 aa  176  5e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  36.57 
 
 		 378 aa  172  7.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  38.89 
 
 		 358 aa  164  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0623  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 337 aa  146  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  27.14 
 
 		 369 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  29.35 
 
 		 533 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  37.16 
 
 		 484 aa  127  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 360 aa  127  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  29.07 
 
 		 359 aa  123  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  32.39 
 
 		 362 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  31.82 
 
 		 364 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  34.63 
 
 		 561 aa  119  7.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  29.72 
 
 		 538 aa  119  9e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  31.13 
 
 		 362 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  34.6 
 
 		 362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  38.01 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  33.65 
 
 		 292 aa  116  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  30.48 
 
 		 840 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  28.62 
 
 		 532 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  29.47 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  33.01 
 
 		 540 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  30.12 
 
 		 547 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3291  MscS mechanosensitive ion channel  27.95 
 
 		 1068 aa  113  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.563171  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1300  MscS mechanosensitive ion channel  28.35 
 
 		 343 aa  113  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.987941  hitchhiker  0.00895683 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  29.39 
 
 		 547 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  36.92 
 
 		 636 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  36.92 
 
 		 636 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  32.88 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  27.27 
 
 		 1067 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  32.69 
 
 		 289 aa  110  5e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  28.73 
 
 		 563 aa  110  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 1072 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 1072 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 1067 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0587  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 1067 aa  109  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0226105 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 1072 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0586  MscS mechanosensitive ion channel  26.94 
 
 		 1067 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0875624 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  26.94 
 
 		 1067 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  29.23 
 
 		 342 aa  106  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  29.68 
 
 		 1117 aa  106  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3392  MscS Mechanosensitive ion channel  32.54 
 
 		 833 aa  105  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  32.13 
 
 		 271 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0786  MscS mechanosensitive ion channel  28.96 
 
 		 1066 aa  105  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.213544  hitchhiker  0.000495101 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  29.26 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  30.8 
 
 		 752 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  31.94 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 544 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  30.28 
 
 		 806 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1206  potassium efflux protein KefA  30.24 
 
 		 1098 aa  104  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  27.69 
 
 		 549 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  31.98 
 
 		 271 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  27.69 
 
 		 549 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  27.69 
 
 		 549 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  26.46 
 
 		 1118 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  26.46 
 
 		 1118 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  28.06 
 
 		 291 aa  103  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  32.39 
 
 		 273 aa  103  6e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  30.58 
 
 		 550 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  30.58 
 
 		 551 aa  103  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  26.88 
 
 		 322 aa  102  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  26.46 
 
 		 1120 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  26.46 
 
 		 1118 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  26.46 
 
 		 1120 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  30.58 
 
 		 551 aa  103  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0014  MscS Mechanosensitive ion channel  34.05 
 
 		 289 aa  102  8e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  28.21 
 
 		 531 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0555  MscS mechanosensitive ion channel  27.67 
 
 		 1060 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0475901  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  29.66 
 
 		 534 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1649  MscS Mechanosensitive ion channel  32.54 
 
 		 256 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  24.31 
 
 		 1134 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2771  MscS Mechanosensitive ion channel  35.26 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5283  MscS Mechanosensitive ion channel  32.85 
 
 		 376 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  30.09 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  26.09 
 
 		 1080 aa  100  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  24 
 
 		 1134 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  27.71 
 
 		 291 aa  100  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1042  MscS Mechanosensitive ion channel  32.35 
 
 		 310 aa  100  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  32.26 
 
 		 360 aa  99.8  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  31.8 
 
 		 753 aa  99.8  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  29.49 
 
 		 1110 aa  99.8  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  29.25 
 
 		 291 aa  99.4  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  27.68 
 
 		 270 aa  99.4  8e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  27 
 
 		 356 aa  99.4  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  35.32 
 
 		 455 aa  99.4  9e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  32.26 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  29.46 
 
 		 456 aa  99  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  29.35 
 
 		 200 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  29.83 
 
 		 305 aa  98.6  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  25.58 
 
 		 1115 aa  98.2  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  28.63 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2527  MscS mechanosensitive ion channel  32.51 
 
 		 427 aa  98.2  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  35.32 
 
 		 458 aa  98.2  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  30.3 
 
 		 275 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0905  MscS Mechanosensitive ion channel  31.33 
 
 		 373 aa  97.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>