168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1234 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0209  large adhesin  83.46 
 
 		 5143 aa  1410    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  56.85 
 
 		 3920 aa  1263    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  100 
 
 		 4526 aa  8854    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1616  large adhesin  51.71 
 
 		 3078 aa  1052    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1085  large adhesin  46.86 
 
 		 3737 aa  542  9.999999999999999e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0383  large adhesin  62.29 
 
 		 4238 aa  528  1e-147  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  54.85 
 
 		 2906 aa  421  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1154  large adhesin  42.8 
 
 		 3554 aa  407  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  55.88 
 
 		 2914 aa  311  2.0000000000000002e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  46.2 
 
 		 2851 aa  291  2e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  31.6 
 
 		 2078 aa  174  3e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  29.28 
 
 		 1813 aa  169  2.0000000000000002e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  30.76 
 
 		 2078 aa  156  8.999999999999999e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  28.93 
 
 		 2075 aa  152  1.0000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  27.32 
 
 		 2073 aa  147  5e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  48.46 
 
 		 2092 aa  107  5e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  35.34 
 
 		 2091 aa  107  6e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  35.22 
 
 		 1014 aa  103  6e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  25.47 
 
 		 1333 aa  103  6e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  30.48 
 
 		 827 aa  98.6  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  28.22 
 
 		 1411 aa  96.3  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  29.07 
 
 		 737 aa  94.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  28.12 
 
 		 1516 aa  92.8  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  28.07 
 
 		 2868 aa  89.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  29.44 
 
 		 617 aa  89.4  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0179  YadA domain protein  35.16 
 
 		 998 aa  86.3  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  28.13 
 
 		 1613 aa  84.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  29.55 
 
 		 1471 aa  84.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  29.55 
 
 		 1471 aa  84.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  29.55 
 
 		 1546 aa  83.6  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1185  hypothetical protein  40.11 
 
 		 239 aa  83.6  0.00000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00454576  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  32.03 
 
 		 2095 aa  83.6  0.00000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  26.79 
 
 		 877 aa  83.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  29.58 
 
 		 1616 aa  83.2  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  27.27 
 
 		 1265 aa  82.4  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  30.42 
 
 		 1588 aa  82.4  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  28.57 
 
 		 1616 aa  78.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1616 aa  78.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0178  YadA domain protein  28.67 
 
 		 691 aa  76.6  0.000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  28.3 
 
 		 1674 aa  76.3  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0086  YadA domain-containing protein  28.06 
 
 		 599 aa  75.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  29.32 
 
 		 1230 aa  75.1  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  37.23 
 
 		 1472 aa  74.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  37.23 
 
 		 1447 aa  74.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  30.07 
 
 		 1854 aa  74.3  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  33.33 
 
 		 1549 aa  74.3  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  37.23 
 
 		 1447 aa  73.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  37.23 
 
 		 1342 aa  73.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  31.37 
 
 		 1186 aa  74.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  37.23 
 
 		 1446 aa  73.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  43.37 
 
 		 810 aa  73.9  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0176  Hemagluttinin domain protein  36.57 
 
 		 209 aa  72.4  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0311  Brp family immunodominant surface antigen  36.36 
 
 		 551 aa  72.4  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1401  putative large adhesin  32.52 
 
 		 1405 aa  72.4  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.018922  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  27.74 
 
 		 3355 aa  72  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  26.7 
 
 		 650 aa  71.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  36.77 
 
 		 1390 aa  70.9  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  35.46 
 
 		 1259 aa  70.5  0.0000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  39.36 
 
 		 716 aa  70.5  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  37.5 
 
 		 279 aa  69.7  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  36.78 
 
 		 4726 aa  69.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  35.06 
 
 		 1190 aa  69.3  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  27.86 
 
 		 1434 aa  68.6  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  29.48 
 
 		 1068 aa  68.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  39.36 
 
 		 716 aa  68.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  28.57 
 
 		 548 aa  68.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0957  outer membrane protein, putative  33.94 
 
 		 2025 aa  67.8  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  29.58 
 
 		 1212 aa  67.4  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03061  adhesin-like protein B  29.82 
 
 		 989 aa  67.4  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  34.34 
 
 		 1440 aa  67  0.000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  39.33 
 
 		 1117 aa  67  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  27.99 
 
 		 1012 aa  66.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  43.37 
 
 		 472 aa  66.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  28.83 
 
 		 962 aa  66.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  35.35 
 
 		 2504 aa  66.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  51.69 
 
 		 4384 aa  65.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0228  YadA domain protein  30.51 
 
 		 600 aa  64.3  0.00000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  37.5 
 
 		 1713 aa  64.3  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  36.78 
 
 		 597 aa  63.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  36.78 
 
 		 597 aa  63.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  36.78 
 
 		 597 aa  63.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  36.94 
 
 		 330 aa  63.9  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1341  YadA domain protein  27.36 
 
 		 563 aa  63.2  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  29.96 
 
 		 2392 aa  63.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  36.7 
 
 		 2396 aa  63.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1334  YadA domain protein  26.46 
 
 		 565 aa  61.6  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  28.05 
 
 		 876 aa  61.6  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  39.1 
 
 		 2141 aa  61.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  27.17 
 
 		 492 aa  61.2  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6312  surface protein  38.54 
 
 		 356 aa  60.1  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  30.65 
 
 		 1090 aa  59.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  30.65 
 
 		 1074 aa  59.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1543  outer membrane protein  37.04 
 
 		 452 aa  60.1  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.316973  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  30.65 
 
 		 1090 aa  59.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  30.65 
 
 		 1090 aa  59.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  30.65 
 
 		 1122 aa  59.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  30.5 
 
 		 1916 aa  59.7  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  30.95 
 
 		 753 aa  58.9  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  30.65 
 
 		 1122 aa  59.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  30.65 
 
 		 1122 aa  59.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>