284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3366 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 213 aa  422  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  68.75 
 
 		 247 aa  289  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  66.99 
 
 		 246 aa  285  4e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  66.67 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  69.61 
 
 		 238 aa  278  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  68 
 
 		 213 aa  276  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  68.34 
 
 		 213 aa  276  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  69.12 
 
 		 238 aa  275  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  69.12 
 
 		 238 aa  275  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  69.12 
 
 		 238 aa  275  4e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  65.57 
 
 		 247 aa  274  8e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  67.98 
 
 		 221 aa  273  1.0000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  65.05 
 
 		 234 aa  267  8e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  62.26 
 
 		 225 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  68.04 
 
 		 230 aa  255  4e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  59.31 
 
 		 213 aa  254  6e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  67.74 
 
 		 218 aa  246  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  64.56 
 
 		 235 aa  246  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3096  lipoate-protein ligase B  61.03 
 
 		 246 aa  245  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0475303  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15410  lipoate-protein ligase B  64.43 
 
 		 214 aa  245  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7404  lipoate-protein ligase B  52.59 
 
 		 268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  61.08 
 
 		 236 aa  241  5e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2107  lipoate-protein ligase B  65.08 
 
 		 227 aa  240  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  63.29 
 
 		 277 aa  239  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1599  lipoate-protein ligase B  54.95 
 
 		 222 aa  238  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000739675 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1267  lipoate-protein ligase B  59.43 
 
 		 221 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118424  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  58.29 
 
 		 251 aa  234  5.0000000000000005e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16460  lipoate-protein ligase B  61.11 
 
 		 232 aa  234  5.0000000000000005e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.843038  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  60.89 
 
 		 234 aa  234  8e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1605  lipoate-protein ligase B  54.64 
 
 		 222 aa  234  8e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16370  lipoate-protein ligase B  61.24 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0223931  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  62.69 
 
 		 214 aa  231  5e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2034  lipoate-protein ligase B  58.96 
 
 		 244 aa  227  9e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21776  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1480  lipoate-protein ligase B  55.1 
 
 		 252 aa  208  4e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.357182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13360  lipoate-protein ligase B  52.5 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  43.69 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  48.5 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  47.12 
 
 		 221 aa  167  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  40.48 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  45.32 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  37.44 
 
 		 240 aa  157  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  46.15 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  47.87 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  39.57 
 
 		 245 aa  154  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  42.31 
 
 		 233 aa  152  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  37.79 
 
 		 231 aa  150  8.999999999999999e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  38.74 
 
 		 231 aa  148  5e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  45.88 
 
 		 222 aa  148  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  40.28 
 
 		 213 aa  148  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1770  lipoate-protein ligase B  39.81 
 
 		 232 aa  145  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.063532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 211 aa  145  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  45.81 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  41.51 
 
 		 230 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  35.55 
 
 		 244 aa  145  6e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  39.44 
 
 		 233 aa  144  7.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 235 aa  144  7.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  36.44 
 
 		 238 aa  144  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  42.16 
 
 		 227 aa  143  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0368  lipoate-protein ligase B  40.93 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  41.63 
 
 		 221 aa  142  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  43.41 
 
 		 262 aa  141  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  42.29 
 
 		 212 aa  141  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  41.95 
 
 		 202 aa  141  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  44.39 
 
 		 213 aa  141  8e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  41.83 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  37.84 
 
 		 492 aa  139  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  39.71 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0744  lipoate-protein ligase B  44.9 
 
 		 259 aa  139  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  43.43 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  38.26 
 
 		 232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  39.22 
 
 		 239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0795  Lipoyl(octanoyl) transferase  42.16 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  38.36 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0763  lipoate-protein ligase B  41.54 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  39.81 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  40.19 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  45.29 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2135  lipoate-protein ligase B  40.91 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  36.19 
 
 		 228 aa  131  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  44.32 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  41.63 
 
 		 383 aa  128  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  39.81 
 
 		 209 aa  127  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  42.93 
 
 		 535 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  40.19 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  38.32 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  39.41 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  41.08 
 
 		 244 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  38.86 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  40.19 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  42.94 
 
 		 240 aa  126  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  43.75 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  39.15 
 
 		 267 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  41.29 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  41.62 
 
 		 244 aa  125  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  40.19 
 
 		 237 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  41.54 
 
 		 365 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1741  lipoate-protein ligase B  40.38 
 
 		 238 aa  125  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0367071 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  38.57 
 
 		 244 aa  124  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  41.29 
 
 		 241 aa  124  7e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>