More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3249 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 238 aa  449  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  52.68 
 
 		 212 aa  185  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  51.72 
 
 		 195 aa  168  9e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  53.01 
 
 		 243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  56.89 
 
 		 193 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  47.98 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  46.77 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  51.33 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5747  lipoprotein signal peptidase  49.47 
 
 		 254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  56 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  47.96 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3428  lipoprotein signal peptidase  48.33 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319038  decreased coverage  0.00618792 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  58.39 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3202  lipoprotein signal peptidase  51.58 
 
 		 232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  46.11 
 
 		 197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1419  lipoprotein signal peptidase  58.13 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  48.1 
 
 		 207 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  49.65 
 
 		 182 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2882  lipoprotein signal peptidase  49.7 
 
 		 182 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  48.28 
 
 		 204 aa  115  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  52.03 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  42.21 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1031  signal peptidase II  52.63 
 
 		 182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0513962  normal  0.0206613 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  40.89 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3153  lipoprotein signal peptidase  50.78 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3093  lipoprotein signal peptidase  50.78 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280943  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  47.59 
 
 		 188 aa  105  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  43.27 
 
 		 167 aa  97.8  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22710  lipoprotein signal peptidase  45.89 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52944  normal  0.101415 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  42.18 
 
 		 155 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  41 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  44.38 
 
 		 190 aa  89.7  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2628  lipoprotein signal peptidase  48.72 
 
 		 182 aa  88.2  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191199  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 		 178 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 162 aa  85.1  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  40.91 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  42.57 
 
 		 153 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  41.48 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  40.29 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  38.27 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  37.65 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13510  signal peptidase II  44.59 
 
 		 156 aa  77.8  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.376411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3938  lipoprotein signal peptidase  38.67 
 
 		 152 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000501111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3945  lipoprotein signal peptidase  38.67 
 
 		 152 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  37.65 
 
 		 167 aa  77.4  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 		 174 aa  77.4  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  33.67 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  40.56 
 
 		 170 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  40.56 
 
 		 170 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2542  lipoprotein signal peptidase  39.33 
 
 		 152 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674041  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  40.56 
 
 		 170 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  31.8 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3720  lipoprotein signal peptidase  38.78 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905453  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  35.23 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  38.19 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2615  signal peptidase II  39.26 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  37.09 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  37.18 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  43.15 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 165 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  41.56 
 
 		 173 aa  75.1  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  35.8 
 
 		 168 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  39.74 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  40.74 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  40.74 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  38.26 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  39.39 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  38.26 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  40.99 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  38.26 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  42.25 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  39.77 
 
 		 168 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1116  signal peptidase II  36.81 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  40.99 
 
 		 171 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 154 aa  72  0.000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 170 aa  72  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  35.4 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  38.31 
 
 		 174 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  43.48 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>