265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1272 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  100 
 
 
347 aa  687    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  77.23 
 
 
349 aa  550  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  68.01 
 
 
349 aa  502  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  63.84 
 
 
356 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  63.56 
 
 
356 aa  441  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  31.05 
 
 
332 aa  177  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  25.97 
 
 
359 aa  119  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  27.76 
 
 
529 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  26.67 
 
 
360 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  26.02 
 
 
523 aa  101  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  25.08 
 
 
360 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  26.85 
 
 
360 aa  93.6  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  25.49 
 
 
360 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  25.57 
 
 
360 aa  89.4  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  24.72 
 
 
515 aa  88.2  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  24.15 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  26.71 
 
 
430 aa  79.3  0.00000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  25.48 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  23.4 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  22.53 
 
 
328 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  23.63 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  26.3 
 
 
332 aa  69.7  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3636  Mammalian cell entry related domain protein  23.84 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  29.1 
 
 
579 aa  68.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2159  virulence factor Mce family protein  28.19 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0878447  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11078  hypothetical protein  25.19 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2985  virulence factor Mce family protein  32.61 
 
 
344 aa  65.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  27.15 
 
 
333 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.74 
 
 
296 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0009  virulence factor Mce family protein  36 
 
 
351 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629178  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4603  virulence factor Mce family protein  34.92 
 
 
346 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.68 
 
 
296 aa  63.2  0.000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2113  Mammalian cell entry related domain protein  22.43 
 
 
316 aa  62.8  0.000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202192  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0960  virulence factor Mce family protein  36.36 
 
 
351 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1867  Mammalian cell entry related domain protein  22.66 
 
 
316 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.449047  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  21.31 
 
 
293 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  27.23 
 
 
296 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  20.75 
 
 
341 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  25.99 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3827  virulence factor Mce family protein  27.22 
 
 
364 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0751  ABC transporter permease  26.37 
 
 
308 aa  60.1  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221313  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3022  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like protein  28.18 
 
 
355 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  25.45 
 
 
266 aa  59.7  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0161  Mammalian cell entry related domain protein  24.13 
 
 
334 aa  59.7  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4169  virulence factor Mce family protein  31.45 
 
 
342 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03740  virulence factor Mce family protein  29.45 
 
 
328 aa  59.3  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0008  virulence factor Mce family protein  25.54 
 
 
345 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611989  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4164  virulence factor Mce family protein  24.31 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3183  Mammalian cell entry related domain protein  30.6 
 
 
150 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1243  virulence factor Mce family protein  25.3 
 
 
344 aa  58.9  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4584  hypothetical protein  25.41 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4616  virulence factor MCE-like protein  31.15 
 
 
344 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.978929  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1854  Mammalian cell entry related domain protein  24.71 
 
 
318 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000329704  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4704  virulence factor Mce family protein  31.15 
 
 
344 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112748  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1526  hypothetical protein  24.4 
 
 
300 aa  57.4  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0265226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2084  Mammalian cell entry related domain protein  21.08 
 
 
564 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2984  ABC transporter, permease component  21.13 
 
 
325 aa  57.4  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395413  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1739  Mammalian cell entry related domain protein  22.56 
 
 
292 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0119  virulence factor MCE-like protein  30.65 
 
 
343 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.410781  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0109  virulence factor Mce family protein  30.65 
 
 
343 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971857  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0705  virulence factor Mce family protein  27.22 
 
 
321 aa  57.4  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0128  virulence factor Mce family protein  30.65 
 
 
343 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0364  virulence factor Mce family protein  31.71 
 
 
342 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2344  Mammalian cell entry related domain protein  21.22 
 
 
314 aa  57  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1999  Mammalian cell entry related domain protein  20.9 
 
 
567 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  26.32 
 
 
308 aa  56.6  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  26.09 
 
 
148 aa  56.2  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  27.61 
 
 
149 aa  56.2  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0961  virulence factor Mce family protein  24.66 
 
 
345 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09350  virulence factor Mce family protein  35.48 
 
 
336 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.960251 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03730  virulence factor Mce family protein  24.89 
 
 
343 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.918695  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11998  MCE-family protein mce3B  32.35 
 
 
342 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000434194  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2254  Mammalian cell entry related domain protein  23.63 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.371924  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  25.63 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  25.63 
 
 
307 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  23.88 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10171  MCE-family protein mce1B  22.36 
 
 
346 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  25.08 
 
 
362 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0560  hypothetical protein  31.58 
 
 
148 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000625618  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  21.88 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.88 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3981  virulence factor Mce family protein  37.23 
 
 
342 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  23.29 
 
 
324 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  28.91 
 
 
148 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  25.64 
 
 
378 aa  54.3  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  24.64 
 
 
293 aa  54.3  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0403  hypothetical protein  28.24 
 
 
146 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304841  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  24.61 
 
 
433 aa  54.3  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3307  Mammalian cell entry related domain protein  23.31 
 
 
339 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185146  normal  0.246163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3979  virulence factor Mce family protein  24.08 
 
 
425 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2218  hypothetical protein  31.85 
 
 
154 aa  53.9  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1655  virulence factor MCE-like protein  34.34 
 
 
342 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  26.97 
 
 
312 aa  53.9  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1628  virulence factor Mce family protein  34.34 
 
 
342 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0651  virulence factor Mce family protein  34.34 
 
 
342 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228257  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2823  virulence factor Mce family protein  24.64 
 
 
361 aa  53.9  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.314486  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1679  virulence factor Mce family protein  34.34 
 
 
342 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.859349  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1110  Mammalian cell entry related domain protein  40.51 
 
 
196 aa  53.9  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820134  normal  0.240411 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4999  virulence factor Mce family protein  32.61 
 
 
344 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0501  virulence factor Mce family protein  30.47 
 
 
278 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298085  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>