More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2257 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2257  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 296 aa  599  1e-170  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304398 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2263  transcriptional regulator, LysR family  65.29 
 
 		 299 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2124  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 297 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.01237  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1667  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1096  transcriptional regulator, LysR family  37.64 
 
 		 297 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000448558  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3622  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1845  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.136314  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1946  transcriptional regulator, LysR family  30.85 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1507  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 304 aa  175  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2882  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130369 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1027  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4170  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 349 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4692  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4468  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 315 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3045  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.458337  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3400  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 296 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0974424  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3815  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 361 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407942 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4763  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0927  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 348 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5498  LysR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 345 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3349  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3582  LysR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283353  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4785  LysR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2571  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.159237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3879  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4579  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1310  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 303 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000494191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4100  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 303 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1403  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1729  LysR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 291 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0978912  normal  0.139934 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0007  LysR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 298 aa  125  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1443  LysR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748078 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0007  LysR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2361  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683125  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0404  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480543  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2122  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.303428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0569  LysR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 290 aa  119  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0960  LysR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37220  LysR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.923921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3195  putative transcriptional regulator  28.35 
 
 		 363 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4745  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.729487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0076  transcriptional regulator, LysR family  29.79 
 
 		 302 aa  113  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6072  transcriptional regulator, LysR family  30.31 
 
 		 311 aa  112  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5155  LysR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 303 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3151  transcriptional regulator  26.12 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4149  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.438214  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2466  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 311 aa  105  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3458  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5281  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.971291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3933  transcriptional regulator, LysR family  27.34 
 
 		 306 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1775  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 304 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0671659 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0309  transcriptional regulator, LysR family protein  23.79 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5126  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 310 aa  102  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0428454 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3123  transcriptional regulator, LysR family  29.8 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1231  transcriptional regulator, LysR family  27.06 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.214878  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0888  transcriptional regulator, LysR family  27.72 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2823  transcriptional regulator, LysR family  31.4 
 
 		 305 aa  99  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.135524  normal  0.141091 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  29.49 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0204  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6251  LysR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 327 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1477  LysR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5605  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1309  LysR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5969  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037011 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6469  LysR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3810  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1312  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0843658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0486  LysR substrate-binding  29 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2004  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 292 aa  97.1  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.079664 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2577  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 310 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.571324  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3079  LysR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 300 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149584  normal  0.0381152 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7088  LysR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 314 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3677  transcriptional regulator, LysR family  29.02 
 
 		 292 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0226  LysR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 288 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0191  LysR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 288 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0195  LysR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 288 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  28.47 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2994  LysR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.735848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0223  transcriptional regulator, LysR family  26.23 
 
 		 288 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3970  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1612  LysR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0230  transcriptional regulator, LysR family  26.23 
 
 		 288 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2365  LysR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01661  putative Rubisco transcriptional regulator  28.23 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0149  putative Rubisco transcriptional regulator  28.16 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 329 aa  94.4  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1370  transcriptional regulator, LysR family  28.22 
 
 		 313 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3549  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450879  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3152  LysR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1939  transcriptional regulator, LysR family  29.29 
 
 		 290 aa  94  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514267  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0205  LysR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5097  transcriptional regulator, LysR family  26.23 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0208  LysR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2562  LysR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1668  transcriptional regulator, LysR family  29.85 
 
 		 296 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1695  putative LysR substrate binding domain  27.35 
 
 		 290 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1647  putative LysR substrate binding domain  27.35 
 
 		 290 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0636291  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26681  putative Rubisco transcriptional regulator  28.16 
 
 		 323 aa  93.2  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0247  transcriptional regulator, LysR family  25.82 
 
 		 288 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1628  putative LysR substrate binding domain  27.35 
 
 		 290 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>