88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1296 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  100 
 
 		 1014 aa  1934    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  41.46 
 
 		 1001 aa  591  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  41.61 
 
 		 1018 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  43.38 
 
 		 959 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  37.02 
 
 		 999 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  35.59 
 
 		 1042 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  34.36 
 
 		 1052 aa  426  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  35.3 
 
 		 1043 aa  425  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  35.96 
 
 		 1047 aa  425  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  35.26 
 
 		 1049 aa  420  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  37.43 
 
 		 1015 aa  420  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  35.86 
 
 		 1047 aa  421  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  35.26 
 
 		 1049 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  37.28 
 
 		 1054 aa  415  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  34.44 
 
 		 1048 aa  411  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  37.24 
 
 		 991 aa  412  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  36.18 
 
 		 1042 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  35.04 
 
 		 1052 aa  409  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  35.05 
 
 		 1045 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  35.14 
 
 		 1053 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  35.04 
 
 		 1052 aa  409  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  34.69 
 
 		 1049 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  33.91 
 
 		 1076 aa  404  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  36.09 
 
 		 1040 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  34.37 
 
 		 1064 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  34.78 
 
 		 1048 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  36.28 
 
 		 1037 aa  395  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  34.31 
 
 		 1064 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  35.57 
 
 		 1016 aa  391  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  30.7 
 
 		 1047 aa  380  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  33.55 
 
 		 1059 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  32.91 
 
 		 977 aa  344  4e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  32.84 
 
 		 1062 aa  342  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  34.52 
 
 		 1000 aa  339  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  32.17 
 
 		 993 aa  336  1e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  35.72 
 
 		 991 aa  333  9e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  33.72 
 
 		 997 aa  323  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  34.38 
 
 		 997 aa  320  9e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  33.1 
 
 		 986 aa  318  4e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  32.61 
 
 		 988 aa  274  6e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  33.23 
 
 		 980 aa  266  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0912  hypothetical protein  21.58 
 
 		 890 aa  169  2e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.216262  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0820  hypothetical protein  19.62 
 
 		 914 aa  167  1.0000000000000001e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.839231  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0263  hypothetical protein  19.41 
 
 		 911 aa  158  5.0000000000000005e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.453707  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.98 
 
 		 958 aa  83.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  22.51 
 
 		 781 aa  79.7  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  27.16 
 
 		 962 aa  77.8  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  26.84 
 
 		 947 aa  77.8  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  18.79 
 
 		 911 aa  72.4  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  27.39 
 
 		 856 aa  72.4  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.82 
 
 		 836 aa  71.2  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  29.08 
 
 		 989 aa  68.6  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  26.73 
 
 		 951 aa  65.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  32.25 
 
 		 864 aa  64.7  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  21.93 
 
 		 919 aa  62.4  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  33.68 
 
 		 915 aa  61.6  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  24.17 
 
 		 994 aa  60.8  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0524  hypothetical protein  23 
 
 		 779 aa  57.4  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  27.22 
 
 		 896 aa  57  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  31.52 
 
 		 846 aa  55.1  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0640  inactivated superfamily I helicase-like protein  20.9 
 
 		 991 aa  54.3  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  22.55 
 
 		 780 aa  52.4  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  25.46 
 
 		 855 aa  52.4  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  30.9 
 
 		 304 aa  51.6  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1570  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  31.87 
 
 		 1043 aa  50.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  25.54 
 
 		 1106 aa  50.8  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  35.71 
 
 		 311 aa  49.3  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  32.7 
 
 		 320 aa  49.7  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1000 aa  49.7  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.28 
 
 		 957 aa  49.7  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  19.94 
 
 		 781 aa  49.3  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2040  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.22 
 
 		 1146 aa  48.1  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  23.91 
 
 		 984 aa  48.1  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  31.18 
 
 		 273 aa  48.1  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1698  hypothetical protein  24.67 
 
 		 922 aa  47.8  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2640  hypothetical protein  30.88 
 
 		 883 aa  47.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0600209  normal  0.0102086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  19.37 
 
 		 1039 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  31.28 
 
 		 294 aa  46.6  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  31.48 
 
 		 313 aa  46.6  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  29.52 
 
 		 280 aa  47  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  19.38 
 
 		 909 aa  46.2  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  31.66 
 
 		 302 aa  46.2  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  25.45 
 
 		 913 aa  45.8  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  29.07 
 
 		 259 aa  45.8  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  31.76 
 
 		 266 aa  45.4  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0987  hypothetical protein  24.05 
 
 		 911 aa  45.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000754464  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  53.66 
 
 		 1052 aa  44.7  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0481  ATP-dependent deoxyribonuclease subunit B  29.61 
 
 		 1151 aa  44.7  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>