More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4596 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4596  regulatory protein TetR  100 
 
 		 196 aa  387  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0039  transcriptional regulator, TetR family  47.64 
 
 		 201 aa  165  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  36.2 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1950  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 240 aa  95.5  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663338  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 222 aa  87.8  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1914  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2079  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.674297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4968  transcriptional regulator, TetR family domain protein  25.76 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4996  transcriptional regulator  25.25 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22560  transcriptional regulator, tetR family  31.55 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0880115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2290  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 208 aa  67.8  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0794358  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1470  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.772741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  36.08 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  33 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  33 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  33 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  31.31 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  27.34 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  33 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  33 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  33 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  25.35 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  29.01 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  28.4 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  25.35 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  29.89 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  25.35 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 233 aa  53.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  25.35 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  25.35 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  31.31 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24.2 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  25.18 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 231 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  34.38 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  34.38 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  34.38 
 
 		 202 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 224 aa  51.6  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  34.38 
 
 		 202 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  25.35 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  34.38 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  34.38 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  29.9 
 
 		 198 aa  51.6  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  25.35 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  34.38 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  34.38 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  34.38 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8404  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 677 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2129  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 210 aa  51.2  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  24.2 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0520  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627434 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  32.79 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3158  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  25.56 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1898  transcriptional regulator BetI  28.73 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  20.71 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 181 aa  49.3  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6159  transcriptional regulator BetI  24.65 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  21.62 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 244 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70970  transcriptional regulator BetI  24.65 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.790986 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 232 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 308 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 221 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1590  transcriptional regulator BetI  34.38 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 223 aa  48.5  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 214 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5242  transcriptional regulator BetI  23.94 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  21.92 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0403  transcriptional regulator BetI  23.97 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0935  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>