More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2205 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
153 aa  317  3e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  41.91 
 
 
149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2098  MarR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
155 aa  107  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0688139  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  41.54 
 
 
157 aa  104  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 
154 aa  102  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2959  transcriptional regulator, MarR family  37.4 
 
 
151 aa  96.3  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000427838 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  43.59 
 
 
153 aa  94.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
161 aa  89.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0643  transcriptional regulator, MarR family  42.61 
 
 
151 aa  89  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0797969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  34.03 
 
 
189 aa  88.6  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0881  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
168 aa  85.5  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 
169 aa  84  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  34.4 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3523  transcriptional regulator, TrmB  30.16 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503632  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  33.05 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  34.82 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1519  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0826678  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  24.43 
 
 
189 aa  61.6  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
153 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  29.13 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10950  transcriptional regulator  30.4 
 
 
175 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279109  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
154 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0115  regulatory protein, MarR  27.94 
 
 
169 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0627652  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3332  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135407  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23740  transcriptional regulator  27.34 
 
 
159 aa  55.1  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  25.41 
 
 
152 aa  55.1  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
157 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
174 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
164 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  32.91 
 
 
148 aa  53.9  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
157 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
157 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  27.01 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  28.38 
 
 
204 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  22.45 
 
 
185 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 
168 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  24.79 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
175 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
158 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  22.45 
 
 
185 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
160 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
181 aa  51.2  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 
160 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 
160 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 
160 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 
160 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
176 aa  50.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
160 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 
160 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 
160 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3159  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
164 aa  50.4  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2713  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 
196 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 
166 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
173 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  28.06 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  24.32 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0797  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  25.95 
 
 
172 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3993  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 
169 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.73498 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  27.21 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
150 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  43.1 
 
 
166 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  22.46 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  29.07 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
141 aa  48.1  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  44.64 
 
 
164 aa  48.1  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  25.22 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  26.61 
 
 
261 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37340  transcriptional regulator  25.44 
 
 
198 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.186615 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
161 aa  47.4  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 
146 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 
172 aa  47.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 
151 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
155 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 
154 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  37.1 
 
 
162 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  31.67 
 
 
187 aa  47.4  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30230  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 
170 aa  47  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.178176 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  23.76 
 
 
144 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
151 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
170 aa  47  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  23.76 
 
 
144 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
151 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 
173 aa  47  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
162 aa  47  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
151 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
152 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>