88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1688 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1688  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 312 aa  600  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0152268  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2591  GntR domain protein  42.11 
 
 		 501 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00937291  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13077  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 490 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.207808  normal  0.861389 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1277  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460205  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1289  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3206  regulatory protein GntR, HTH  44.29 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1778  GntR domain-containing protein  27.98 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.393282  normal  0.0406668 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  24.32 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  25.11 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  30.69 
 
 		 226 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  28.35 
 
 		 226 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2688  GntR family transcriptional regulator  24 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.292579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01758  hypothetical protein  29.81 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  28.63 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4780  regulatory protein GntR HTH  38.53 
 
 		 259 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1106  GntR domain-containing protein  30 
 
 		 251 aa  50.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 238 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  28.75 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4707  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 229 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  34.19 
 
 		 250 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 255 aa  49.7  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0889  regulatory protein GntR, HTH  37.5 
 
 		 238 aa  49.3  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  27.35 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4081  GntR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4311  GntR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173639  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4148  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4157  GntR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3635  regulatory protein GntR, HTH  34.72 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0356922  normal  0.468942 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3213  regulatory protein GntR HTH  27.62 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2288  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00127376  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  28.93 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  26.55 
 
 		 241 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3218  GntR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 340 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00133147  normal  0.894655 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 256 aa  47.4  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4265  GntR domain-containing protein  25.75 
 
 		 256 aa  47.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2979  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0803123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  29.53 
 
 		 234 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  24.41 
 
 		 239 aa  47  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3667  GntR domain-containing protein  32 
 
 		 245 aa  47.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0203377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 255 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1917  GntR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 317 aa  47  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00000235972  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  25.49 
 
 		 254 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 221 aa  46.6  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  22.95 
 
 		 226 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  36.73 
 
 		 260 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1631  GntR domain protein  28.64 
 
 		 267 aa  46.2  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3813  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 282 aa  46.2  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1580  GntR domain protein  26.09 
 
 		 261 aa  45.8  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4555  regulatory protein GntR HTH  42.37 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6169  regulatory protein GntR HTH  34.58 
 
 		 234 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.398183 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2114  GntR domain-containing protein  39.33 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4590  GntR domain-containing protein  31.79 
 
 		 263 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.845166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1785  regulatory protein GntR, HTH  45.59 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.711067  normal  0.392955 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  27.85 
 
 		 216 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4790  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 245 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4496  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 245 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4409  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 245 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1787  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 239 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160831  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0699  GntR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 223 aa  44.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  36.59 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 232 aa  44.3  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  24.61 
 
 		 226 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1621  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 239 aa  43.9  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00823964  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4409  GntR domain protein  32.45 
 
 		 230 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  26.72 
 
 		 249 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 247 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5729  GntR-like  33.33 
 
 		 285 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6093  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 285 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6576  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 285 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0880698  normal  0.0348714 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1632  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 232 aa  43.9  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.367647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4965  regulatory protein GntR, HTH  35.9 
 
 		 247 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1686  regulatory protein GntR HTH  34.23 
 
 		 281 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00156623  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 215 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  27.36 
 
 		 231 aa  43.5  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2324  regulatory protein  37.68 
 
 		 242 aa  43.5  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1908  GntR domain protein  27.53 
 
 		 261 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287646  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3599  GntR domain-containing protein  34.72 
 
 		 251 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  24.55 
 
 		 241 aa  43.1  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  47.17 
 
 		 242 aa  42.7  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 218 aa  42.7  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 216 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1676  regulatory protein GntR HTH  28.45 
 
 		 275 aa  42.7  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344673 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 235 aa  42.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2982  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 228 aa  42.7  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1447  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 243 aa  42.4  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.384199 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>