More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0090 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 177 aa  366  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  40.33 
 
 		 191 aa  136  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  39.55 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  38.67 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  37.64 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35 
 
 		 196 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  33.89 
 
 		 196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 185 aa  111  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  34.44 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  31.4 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  32.42 
 
 		 183 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  31.4 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 182 aa  104  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0927  phosphoglycerate mutase  37.25 
 
 		 194 aa  105  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0214676  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_002950  PG0704  phosphoglycerate mutase family protein  35.91 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000429574 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  31.25 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  31.32 
 
 		 197 aa  97.1  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  35.53 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_002950  PG2026  phosphoglycerate mutase family protein  35.36 
 
 		 177 aa  95.5  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0128823 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  31.28 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  31.28 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  31.28 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  31.28 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  31.28 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  31.28 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  29.84 
 
 		 196 aa  94.4  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 		 195 aa  93.6  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.16 
 
 		 196 aa  91.7  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0839  phosphoglycerate mutase family protein, putative  28.73 
 
 		 196 aa  91.7  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543457  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2499  phosphoglycerate mutase  31.67 
 
 		 194 aa  91.7  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458709  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2456  alpha-ribazole phosphatase  31.46 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1840  phosphoglycerate mutase  30.9 
 
 		 194 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0552863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2451  phosphoglycerate mutase  30.9 
 
 		 194 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20579  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1193  phosphoglycerate mutase family protein  30.34 
 
 		 616 aa  88.6  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.670037  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0843  alpha-ribazole phosphatase  30.34 
 
 		 195 aa  88.2  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 200 aa  88.2  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2609  phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 		 181 aa  87.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0677  phosphoglycerate mutase  26.88 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0384229  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2367  alpha-ribazole phosphatase  30.43 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  32.61 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5782  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.67 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  33.92 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1026  Phosphoglycerate mutase  30.27 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  28.19 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  31.14 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0656  Phosphoglycerate mutase  25.27 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161157  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1028  phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2658  phosphoglycerate mutase  26.78 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0454  phosphoglycerate mutase  28.73 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.079929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.49 
 
 		 200 aa  72  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.49 
 
 		 200 aa  72  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  29.55 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  29.61 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  28.02 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  25.99 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  27.96 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003690  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  30.13 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  27.47 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  28.02 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  30.72 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  32.1 
 
 		 204 aa  67  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  27.72 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  28.95 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  28.22 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  26.98 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  28.72 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  31.46 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0521  fructose-2,6-biphosphatase  23.5 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.37319  normal  0.0108392 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  30.51 
 
 		 213 aa  64.3  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  27.27 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  29.17 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  30.17 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  27.91 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  29.3 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.65 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0110  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.52 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0908349  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  27.22 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  25.41 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  28.19 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  28.25 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  28.92 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  26.06 
 
 		 197 aa  62  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  29.41 
 
 		 208 aa  62  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  24.86 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0480  phosphoglycerate mutase  27.43 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.393842  normal  0.153486 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  27.44 
 
 		 227 aa  61.2  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  28.82 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  26.16 
 
 		 188 aa  60.8  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 196 aa  60.8  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  30.72 
 
 		 233 aa  60.8  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>