More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2208 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2208  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 
269 aa  549  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.247562  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1459  tryptophan synthase subunit alpha  82.02 
 
 
268 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00021114  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1419  tryptophan synthase subunit alpha  81.65 
 
 
268 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1917  tryptophan synthase subunit alpha  81.65 
 
 
268 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000303203 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1601  tryptophan synthase subunit alpha  81.65 
 
 
268 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0807887 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1854  tryptophan synthase subunit alpha  81.65 
 
 
268 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.230554 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1859  tryptophan synthase subunit alpha  81.27 
 
 
268 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.584641  normal  0.530099 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01234  tryptophan synthase subunit alpha  82.02 
 
 
268 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2388  tryptophan synthase, alpha subunit  82.02 
 
 
268 aa  442  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.555037  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2002  tryptophan synthase subunit alpha  79.03 
 
 
268 aa  441  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2301  tryptophan synthase subunit alpha  79.03 
 
 
268 aa  441  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2367  tryptophan synthase subunit alpha  82.02 
 
 
268 aa  442  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.189882  hitchhiker  0.000000219332 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01244  hypothetical protein  82.02 
 
 
268 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1369  tryptophan synthase subunit alpha  82.02 
 
 
268 aa  442  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.787892  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1872  tryptophan synthase subunit alpha  81.27 
 
 
268 aa  437  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000234299 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1485  tryptophan synthase subunit alpha  81.95 
 
 
268 aa  440  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1892  tryptophan synthase subunit alpha  81.65 
 
 
268 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2672  tryptophan synthase, alpha subunit  78.28 
 
 
268 aa  432  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000213592 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1937  tryptophan synthase, alpha subunit  76.32 
 
 
269 aa  421  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2177  tryptophan synthase, alpha subunit  75.66 
 
 
269 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2047  tryptophan synthase subunit alpha  77.9 
 
 
268 aa  397  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1937  tryptophan synthase subunit alpha  78.28 
 
 
268 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.66163  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2317  tryptophan synthase subunit alpha  77.78 
 
 
271 aa  394  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003083  tryptophan synthase alpha chain  61.94 
 
 
268 aa  346  3e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1585  tryptophan synthase subunit alpha  64.91 
 
 
269 aa  343  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02763  tryptophan synthase subunit alpha  60.82 
 
 
268 aa  340  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2727  tryptophan synthase subunit alpha  66.29 
 
 
273 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3024  tryptophan synthase subunit alpha  65.91 
 
 
278 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1055  tryptophan synthase, alpha subunit  60.38 
 
 
270 aa  336  2.9999999999999997e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2917  tryptophan synthase subunit alpha  63.64 
 
 
272 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.410631  normal  0.883222 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2706  tryptophan synthase subunit alpha  65.91 
 
 
273 aa  335  5e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1515  tryptophan synthase subunit alpha  65.53 
 
 
278 aa  335  5e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.157433  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2408  tryptophan synthase subunit alpha  65.53 
 
 
278 aa  335  7e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1659  tryptophan synthase subunit alpha  66.29 
 
 
278 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681458  hitchhiker  0.0000116704 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1457  tryptophan synthase subunit alpha  65.15 
 
 
278 aa  333  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1523  tryptophan synthase subunit alpha  65.15 
 
 
278 aa  332  3e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.107227 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2806  tryptophan synthase subunit alpha  65.53 
 
 
273 aa  332  4e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.397521 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0791  tryptophan synthase subunit alpha  64.42 
 
 
268 aa  332  6e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000662896  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1681  tryptophan synthase subunit alpha  64.02 
 
 
272 aa  331  6e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3527  tryptophan synthase, alpha subunit  59.04 
 
 
282 aa  326  3e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2455  tryptophan synthase subunit alpha  62.88 
 
 
281 aa  325  5e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2256  tryptophan synthase subunit alpha  62.5 
 
 
267 aa  323  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1424  tryptophan synthase subunit alpha  62.88 
 
 
267 aa  322  5e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1149  tryptophan synthase subunit alpha  60.82 
 
 
268 aa  319  3e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2134  tryptophan synthase subunit alpha  63.53 
 
 
266 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.713088  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2834  tryptophan synthase, alpha subunit  56.77 
 
 
280 aa  285  7e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02293  tryptophan synthase subunit alpha  57.14 
 
 
263 aa  281  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  44.53 
 
 
265 aa  218  6e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0214  tryptophan synthase subunit alpha  43.73 
 
 
275 aa  203  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  40.08 
 
 
280 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  41.87 
 
 
274 aa  185  6e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  38.87 
 
 
264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  36.47 
 
 
259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  39.16 
 
 
259 aa  182  7e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  38.78 
 
 
256 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  38.46 
 
 
280 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  38.7 
 
 
275 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  38.43 
 
 
271 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  38.04 
 
 
266 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0192  tryptophan synthase, alpha subunit  37.3 
 
 
267 aa  176  3e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 
267 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  35.07 
 
 
263 aa  176  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  36.23 
 
 
279 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 
267 aa  176  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  37.26 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  40.16 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  38.93 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  37.17 
 
 
271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  37.8 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  38.33 
 
 
272 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  35.23 
 
 
265 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  36.23 
 
 
266 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  36.33 
 
 
261 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  38.87 
 
 
269 aa  170  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  37.89 
 
 
271 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  40.09 
 
 
278 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  38.66 
 
 
269 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  37.14 
 
 
278 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1301  tryptophan synthase subunit alpha  37.7 
 
 
266 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.699121  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  37.92 
 
 
269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  35.71 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  37.4 
 
 
271 aa  166  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  37.17 
 
 
267 aa  166  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  35.09 
 
 
265 aa  166  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  37.92 
 
 
269 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  37.76 
 
 
256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  35.06 
 
 
278 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  35.47 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  35.85 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  36.23 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  37.92 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  36.6 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  35.11 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  36.43 
 
 
270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  36.51 
 
 
302 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  35.79 
 
 
266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  35.22 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  40.07 
 
 
267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1690  tryptophan synthase subunit alpha  35.8 
 
 
256 aa  163  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  32.46 
 
 
268 aa  163  3e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>