71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2710 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2710  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 226 aa  461  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2704  transcriptional regulator, CdaR  45.05 
 
 		 412 aa  173  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4880  putative transcriptional regulator, PucR family  45.31 
 
 		 522 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.750606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  26.55 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  38.24 
 
 		 511 aa  55.1  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  38.46 
 
 		 407 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  31.33 
 
 		 529 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.37 
 
 		 445 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  48 
 
 		 547 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  42.65 
 
 		 611 aa  51.6  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2798  putative DNA-binding protein  52 
 
 		 530 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  35.38 
 
 		 537 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2432  transcriptional regulator, CdaR  33.6 
 
 		 514 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5270  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 522 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16716  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  47.83 
 
 		 525 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  36.67 
 
 		 554 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  36.67 
 
 		 554 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  36.67 
 
 		 554 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1305  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  36.84 
 
 		 540 aa  48.9  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2516  transcriptional regulator CdaR  37.97 
 
 		 650 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 552 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  30.43 
 
 		 459 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 514 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  35.29 
 
 		 411 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  44.9 
 
 		 501 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 479 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  43.55 
 
 		 525 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  42.31 
 
 		 478 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  44.23 
 
 		 480 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 537 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  38.03 
 
 		 510 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  38.27 
 
 		 515 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  43.55 
 
 		 525 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  38.27 
 
 		 515 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  38.27 
 
 		 515 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  30.15 
 
 		 454 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  32.73 
 
 		 518 aa  45.4  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  30.08 
 
 		 410 aa  45.4  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  38.18 
 
 		 498 aa  45.4  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2331  transcriptional regulator, CdaR  32.79 
 
 		 406 aa  45.4  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1946  putative DNA-binding protein  35.64 
 
 		 514 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  24.5 
 
 		 504 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  30.08 
 
 		 410 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  28.37 
 
 		 429 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  40 
 
 		 505 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  39.22 
 
 		 392 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  30.08 
 
 		 410 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  30.08 
 
 		 410 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  30.08 
 
 		 410 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  30.08 
 
 		 410 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  30.08 
 
 		 410 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  38.98 
 
 		 512 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 429 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  44.19 
 
 		 512 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 429 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  33.64 
 
 		 520 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 429 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  37.5 
 
 		 681 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  35.71 
 
 		 453 aa  43.1  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  40.74 
 
 		 495 aa  43.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  44.26 
 
 		 419 aa  42.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 403 aa  42.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 464 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  27.18 
 
 		 486 aa  42.4  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  40 
 
 		 553 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  29.14 
 
 		 397 aa  42.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  33.96 
 
 		 616 aa  42  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  42.22 
 
 		 473 aa  42  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  33.82 
 
 		 392 aa  42  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 408 aa  41.6  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  37.5 
 
 		 538 aa  41.6  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>