More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0912 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0912  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 202 aa  417  1e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0194  30S ribosomal protein S4  93.56 
 
 		 202 aa  401  1e-111  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0388  30S ribosomal protein S4  71.64 
 
 		 204 aa  308  4e-83  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0583  ribosomal protein S4  55.78 
 
 		 205 aa  234  5.0000000000000005e-61  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4095  30S ribosomal protein S4  52.24 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5277  30S ribosomal protein S4  52.74 
 
 		 205 aa  215  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.9692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0823  30S ribosomal protein S4  54.55 
 
 		 205 aa  215  4e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0830  30S ribosomal protein S4  54.55 
 
 		 205 aa  214  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2396  30S ribosomal protein S4  54.04 
 
 		 205 aa  214  9e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0105  30S ribosomal protein S4  52.53 
 
 		 205 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0416  30S ribosomal protein S4  51.24 
 
 		 205 aa  213  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338288  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2249  30S ribosomal protein S4  53.73 
 
 		 205 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0123403  normal  0.0465366 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5204  30S ribosomal protein S4  51.74 
 
 		 205 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.228879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4737  30S ribosomal protein S4  51.74 
 
 		 205 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2107  30S ribosomal protein S4  52.02 
 
 		 206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0359  30S ribosomal protein S4  52.24 
 
 		 205 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4303  30S ribosomal protein S4  50.51 
 
 		 206 aa  211  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0826  30S ribosomal protein S4  50.51 
 
 		 205 aa  211  7.999999999999999e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0783117  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0701  30S ribosomal protein S4  48.99 
 
 		 204 aa  210  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1514  30S ribosomal protein S4  52.02 
 
 		 205 aa  209  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1256  30S ribosomal protein S4  51.52 
 
 		 205 aa  209  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal  0.108405 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0664  30S ribosomal protein S4  53.54 
 
 		 204 aa  209  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359087  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1740  30S ribosomal protein S4  51.24 
 
 		 205 aa  208  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2948  30S ribosomal protein S4  48.99 
 
 		 206 aa  208  5e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0134327 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2283  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 206 aa  207  7e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0958  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 206 aa  207  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0208239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3514  30S ribosomal protein S4  48.73 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.512589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2156  30S ribosomal protein S4  50.51 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1947  30S ribosomal protein S4  50.51 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.515321  normal  0.962011 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2214  30S ribosomal protein S4  48.48 
 
 		 206 aa  205  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3699  30S ribosomal protein S4  48.99 
 
 		 205 aa  204  7e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.658744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1603  30S ribosomal protein S4  49.49 
 
 		 205 aa  204  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.176255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1765  30S ribosomal protein S4  49.49 
 
 		 205 aa  204  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2583  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 206 aa  203  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal  0.610834 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1777  30S ribosomal protein S4  48.99 
 
 		 205 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1316  30S ribosomal protein S4  47.98 
 
 		 205 aa  202  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0954  30S ribosomal protein S4  48.99 
 
 		 206 aa  203  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1270  30S ribosomal protein S4  48.99 
 
 		 205 aa  203  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450634  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1927  30S ribosomal protein S4  48.99 
 
 		 205 aa  201  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5388  30S ribosomal protein S4  47.47 
 
 		 205 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1644  30S ribosomal protein S4  46.97 
 
 		 205 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0786  30S ribosomal protein S4  51.01 
 
 		 203 aa  198  6e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171275  normal  0.376942 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1016  30S ribosomal protein S4  45.96 
 
 		 205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0662506  normal  0.784633 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2245  30S ribosomal protein S4  49.49 
 
 		 203 aa  192  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.892305  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1140  30S ribosomal protein S4  47.47 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.768431  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  40.82 
 
 		 200 aa  152  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  40.82 
 
 		 200 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  39.8 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0874  30S ribosomal protein S4  36.55 
 
 		 205 aa  149  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.0803992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1018  30S ribosomal protein S4  36.55 
 
 		 205 aa  149  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000010559  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  38.27 
 
 		 203 aa  147  9e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  38.27 
 
 		 203 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  38.78 
 
 		 203 aa  145  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  38.78 
 
 		 203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  40.82 
 
 		 200 aa  145  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  40.82 
 
 		 200 aa  145  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0171  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.1 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.295675 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  41.12 
 
 		 203 aa  142  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  39.8 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4369  ribosomal protein S4  39.59 
 
 		 201 aa  141  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1284  30S ribosomal protein S4  39.8 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000240031  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  40.61 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0628  ribosomal protein S4  39.66 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3530  30S ribosomal protein S4  39.29 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417771  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  38.27 
 
 		 203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1046  30S ribosomal protein S4  40.98 
 
 		 207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1013  30S ribosomal protein S4  36.68 
 
 		 203 aa  138  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0175272  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5891  RNA-binding S4 domain protein  47.45 
 
 		 146 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0625  30S ribosomal protein S4  39.02 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0397  30S ribosomal protein S4  39.02 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  39.09 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5046  30S ribosomal protein S4  37.56 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  38.27 
 
 		 200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  35.71 
 
 		 203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  38.07 
 
 		 201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  38.78 
 
 		 200 aa  135  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  38.78 
 
 		 200 aa  135  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  38.78 
 
 		 200 aa  135  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05845  30S ribosomal protein S4  37.88 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.16626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  38.78 
 
 		 200 aa  135  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  38.78 
 
 		 200 aa  135  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  38.78 
 
 		 200 aa  135  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  38.78 
 
 		 200 aa  135  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0763  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.51 
 
 		 211 aa  135  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  39.39 
 
 		 205 aa  135  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0405  30S ribosomal protein S4  38.54 
 
 		 207 aa  135  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.916178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  38.5 
 
 		 208 aa  135  5e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3152  ribosomal protein S4  35.18 
 
 		 203 aa  135  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  38.07 
 
 		 224 aa  135  5e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  35.53 
 
 		 200 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4218  30S ribosomal protein S4  37.56 
 
 		 207 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  37.19 
 
 		 203 aa  134  7.000000000000001e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  34.52 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0176  ribosomal protein S4  38.07 
 
 		 200 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18917  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04497  30S ribosomal protein S4  38.19 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.777393  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  37.69 
 
 		 262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  38.27 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0566  30S ribosomal protein S4  39.5 
 
 		 202 aa  132  5e-30  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1815  ribosomal protein S4  36.95 
 
 		 208 aa  132  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.217551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  35.9 
 
 		 200 aa  131  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>