More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2529 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  50.52 
 
 		 807 aa  731    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 864 aa  1709    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  34.66 
 
 		 981 aa  449  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  33.46 
 
 		 795 aa  420  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  32.34 
 
 		 816 aa  350  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  30.68 
 
 		 784 aa  345  2e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  42.07 
 
 		 843 aa  224  4.9999999999999996e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  47.32 
 
 		 806 aa  217  8e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  44.16 
 
 		 1115 aa  216  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  38.76 
 
 		 1133 aa  210  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  42.6 
 
 		 1120 aa  209  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  42.6 
 
 		 1120 aa  209  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  42.6 
 
 		 1120 aa  209  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  42.6 
 
 		 1120 aa  209  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  42.6 
 
 		 1118 aa  209  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  42.6 
 
 		 1120 aa  209  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  42.6 
 
 		 1120 aa  209  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  42.6 
 
 		 1120 aa  209  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  42.6 
 
 		 1120 aa  209  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  44.06 
 
 		 1118 aa  208  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  41.72 
 
 		 1120 aa  208  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  41.72 
 
 		 1120 aa  208  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  44.06 
 
 		 1118 aa  208  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  41.72 
 
 		 1120 aa  208  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  44.06 
 
 		 1120 aa  208  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  44.06 
 
 		 1120 aa  208  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  44.06 
 
 		 1118 aa  208  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  44.03 
 
 		 1130 aa  203  9e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  48.86 
 
 		 861 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  41.35 
 
 		 1110 aa  196  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  41.16 
 
 		 1128 aa  194  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  43.23 
 
 		 840 aa  194  5e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  40.35 
 
 		 874 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  41.13 
 
 		 1111 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  36.62 
 
 		 322 aa  191  4e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  42.73 
 
 		 1144 aa  191  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  39.38 
 
 		 1134 aa  189  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  38.63 
 
 		 1117 aa  186  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  33.82 
 
 		 1117 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  40.48 
 
 		 796 aa  186  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  39.06 
 
 		 1134 aa  184  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  33.44 
 
 		 321 aa  182  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  46.01 
 
 		 299 aa  181  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  41.41 
 
 		 1102 aa  180  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  37.2 
 
 		 1235 aa  180  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  40.15 
 
 		 1166 aa  180  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  41.85 
 
 		 1102 aa  179  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  39.92 
 
 		 859 aa  177  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  40.91 
 
 		 825 aa  177  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  39.91 
 
 		 849 aa  174  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  41.41 
 
 		 685 aa  173  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  40.38 
 
 		 847 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  40.83 
 
 		 1158 aa  172  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  40.38 
 
 		 847 aa  172  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3826  MscS Mechanosensitive ion channel  45.28 
 
 		 444 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 843 aa  171  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  42.33 
 
 		 636 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  42.33 
 
 		 636 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  29.54 
 
 		 844 aa  171  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5759  potassium efflux protein KefA  40.37 
 
 		 1118 aa  171  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738971  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66400  potassium efflux protein KefA  40.37 
 
 		 1118 aa  170  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1206  potassium efflux protein KefA  42.47 
 
 		 1098 aa  169  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  31.67 
 
 		 832 aa  169  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  38.72 
 
 		 842 aa  169  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  40.89 
 
 		 291 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1632  mechanosensitive ion channel family protein  40.1 
 
 		 782 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274059  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  38.75 
 
 		 785 aa  166  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  38.75 
 
 		 891 aa  166  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  34.58 
 
 		 877 aa  166  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 845 aa  165  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  37.39 
 
 		 472 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  33.65 
 
 		 830 aa  164  8.000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5067  potassium efflux protein KefA  42.52 
 
 		 1102 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4940  potassium efflux protein KefA  42.52 
 
 		 1102 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0101  putative AefA  47.14 
 
 		 338 aa  162  4e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  33.16 
 
 		 752 aa  161  5e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  39.91 
 
 		 637 aa  160  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  31.27 
 
 		 287 aa  160  9e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  41.83 
 
 		 560 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  37.83 
 
 		 1110 aa  159  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  40.47 
 
 		 428 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  43.37 
 
 		 298 aa  157  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2035  MscS Mechanosensitive ion channel  39.81 
 
 		 447 aa  157  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  30.54 
 
 		 868 aa  156  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  36.51 
 
 		 1127 aa  157  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  35.94 
 
 		 825 aa  155  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  36.87 
 
 		 860 aa  154  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2010  MscS Mechanosensitive ion channel  39.32 
 
 		 447 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  32.48 
 
 		 867 aa  153  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  34.22 
 
 		 484 aa  153  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 479 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3012  MscS mechanosensitive ion channel  37.44 
 
 		 297 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  35 
 
 		 1105 aa  148  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1903  MscS Mechanosensitive ion channel  43.69 
 
 		 303 aa  147  6e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  30.73 
 
 		 910 aa  147  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0555  MscS mechanosensitive ion channel  36.32 
 
 		 1060 aa  147  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0475901  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  34.19 
 
 		 753 aa  146  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  33.82 
 
 		 853 aa  146  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  37.32 
 
 		 301 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08271  hypothetical protein  38.16 
 
 		 329 aa  146  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>