More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2365 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 482 aa  974    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  67.96 
 
 		 439 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  52.35 
 
 		 461 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  45.88 
 
 		 476 aa  378  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  47.06 
 
 		 435 aa  365  1e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  45.07 
 
 		 453 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  26.58 
 
 		 471 aa  120  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  25.9 
 
 		 427 aa  113  7.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  27.63 
 
 		 491 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  30.09 
 
 		 449 aa  107  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  27.94 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  25.89 
 
 		 565 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  25.93 
 
 		 441 aa  94.7  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  27.46 
 
 		 436 aa  94.4  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  30.14 
 
 		 627 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  29.33 
 
 		 420 aa  94.4  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  28.05 
 
 		 731 aa  93.2  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  23.97 
 
 		 483 aa  92  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  21.41 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  27.44 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  27.87 
 
 		 435 aa  89.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  26.28 
 
 		 462 aa  87.4  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 		 435 aa  87.4  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  24.63 
 
 		 417 aa  87.4  5e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  27.18 
 
 		 440 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  27.92 
 
 		 419 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 525 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.44 
 
 		 456 aa  84.7  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  24.19 
 
 		 463 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  23.73 
 
 		 470 aa  84.3  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  24.64 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 467 aa  84  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  26.72 
 
 		 443 aa  84  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  24.1 
 
 		 446 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  24.47 
 
 		 496 aa  83.2  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  22.4 
 
 		 471 aa  83.2  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  24.45 
 
 		 419 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  27.54 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  26.77 
 
 		 635 aa  82  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  26.41 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  23.68 
 
 		 437 aa  80.1  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1525  outer membrane efflux protein  25.58 
 
 		 442 aa  79.7  0.00000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000580745  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  26.09 
 
 		 576 aa  78.2  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1650  Outer membrane efflux protein  25.29 
 
 		 499 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0374464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  24.09 
 
 		 499 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  24.28 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 419 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  23.74 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2330  RND family outer membrane efflux protein  25.17 
 
 		 594 aa  74.7  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  24.23 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0515  outer membrane efflux protein  28.88 
 
 		 578 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  26.27 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0532  outer membrane efflux protein  28.88 
 
 		 578 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52231  normal  0.0114882 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  24.89 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  25.87 
 
 		 535 aa  74.3  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  23.32 
 
 		 498 aa  74.7  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  20 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  27.09 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  29.85 
 
 		 972 aa  73.9  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5589  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.84 
 
 		 498 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  25.06 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  27.03 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  26.44 
 
 		 460 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  23.64 
 
 		 471 aa  73.2  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3468  outer membrane efflux protein  23.46 
 
 		 448 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000163735  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  21.38 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1531  outer membrane efflux protein  24.12 
 
 		 472 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  23.36 
 
 		 458 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  24.63 
 
 		 523 aa  71.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  23.43 
 
 		 464 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  22.02 
 
 		 501 aa  71.2  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  27.54 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.17 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.23 
 
 		 483 aa  70.9  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  21.63 
 
 		 458 aa  70.5  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0186  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.45 
 
 		 485 aa  70.1  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.99 
 
 		 478 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3101  outer membrane efflux protein  26.62 
 
 		 465 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00986507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.3 
 
 		 480 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4942  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755187  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.26 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  22.17 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2020  outer membrane efflux protein  23.74 
 
 		 491 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0936605  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  23.31 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.18 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  22.69 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.83 
 
 		 522 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  26.49 
 
 		 499 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  21.5 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2832  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.65 
 
 		 520 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  23.86 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0360  RND family outer membrane efflux protein  23.84 
 
 		 574 aa  67.4  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  23.62 
 
 		 447 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  24 
 
 		 477 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.7 
 
 		 477 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  25.17 
 
 		 462 aa  66.6  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0749  outer membrane efflux protein  23.12 
 
 		 490 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.29 
 
 		 512 aa  66.6  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02231  RND family outer membrane efflux protein  26.74 
 
 		 577 aa  66.6  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1941  outer membrane efflux protein  23.02 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>