More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0187 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 
439 aa  883    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.15 
 
 
465 aa  241  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.27 
 
 
467 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.89 
 
 
443 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.52 
 
 
439 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.68 
 
 
444 aa  182  7e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.96 
 
 
444 aa  180  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.86 
 
 
445 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.23 
 
 
445 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.52 
 
 
449 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4148  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.72 
 
 
492 aa  162  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.516156  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.74 
 
 
470 aa  150  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.11 
 
 
443 aa  140  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0591  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.71 
 
 
452 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.63 
 
 
447 aa  114  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.08 
 
 
445 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.6 
 
 
445 aa  105  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.78 
 
 
438 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.65 
 
 
446 aa  100  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.24 
 
 
433 aa  100  6e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0978  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.21 
 
 
427 aa  100  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0215485  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  26.84 
 
 
441 aa  99  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.85 
 
 
462 aa  97.1  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  27.27 
 
 
478 aa  96.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  22.22 
 
 
479 aa  96.3  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  32.69 
 
 
441 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0882  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.53 
 
 
436 aa  96.3  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  25 
 
 
441 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.6 
 
 
445 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1234  pmbA protein  26.53 
 
 
444 aa  94.7  3e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2060  pmbA protein, putative  25.71 
 
 
446 aa  94.4  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525901  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  24.01 
 
 
453 aa  94  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.32 
 
 
457 aa  94  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.06 
 
 
479 aa  92  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  28.03 
 
 
453 aa  91.3  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  22.25 
 
 
453 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  26.89 
 
 
449 aa  90.1  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2442  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.68 
 
 
446 aa  89.7  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.36 
 
 
450 aa  89.7  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  23.42 
 
 
511 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.57 
 
 
435 aa  89  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1709  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.95 
 
 
445 aa  89  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0311479  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.44 
 
 
435 aa  89  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  26.89 
 
 
449 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1687  putative Zn-dependent protease, pmbA-like protein  24.15 
 
 
464 aa  88.2  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  23.41 
 
 
472 aa  88.2  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  21.92 
 
 
456 aa  87  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.42 
 
 
435 aa  86.3  9e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  22.25 
 
 
453 aa  86.3  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  22.25 
 
 
453 aa  86.3  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.01 
 
 
446 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3530  PmbA/TldD family protein  27.65 
 
 
436 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314475  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  28.19 
 
 
445 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2361  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.84 
 
 
448 aa  84.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1943  microcin-processing peptidase 1  28.36 
 
 
466 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal  0.426455 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.34 
 
 
468 aa  84.3  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0044  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.19 
 
 
442 aa  84.3  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.75 
 
 
430 aa  83.6  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2704  hypothetical protein  24.4 
 
 
464 aa  83.6  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147717  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  25.19 
 
 
457 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  22.02 
 
 
454 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  22.02 
 
 
454 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  23.91 
 
 
443 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  25.64 
 
 
453 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  22.02 
 
 
453 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  22.02 
 
 
453 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.3 
 
 
441 aa  82.4  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  23.41 
 
 
441 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1346  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.81 
 
 
465 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200432  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  28.51 
 
 
439 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0310  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.06 
 
 
446 aa  80.9  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0108287 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3428  hypothetical protein  24.07 
 
 
456 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.7 
 
 
471 aa  80.9  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3491  hypothetical protein  24.07 
 
 
456 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24821  normal  0.242027 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0413  microcin-processing peptidase 1  22.86 
 
 
452 aa  80.5  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0570132  normal  0.116989 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1852  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.49 
 
 
465 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405759  decreased coverage  0.000697877 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.95 
 
 
465 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3182  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.58 
 
 
463 aa  80.1  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167211  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0754  hypothetical protein  23.8 
 
 
454 aa  79  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2764  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.68 
 
 
446 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0396  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.53 
 
 
436 aa  79  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0206547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  27.66 
 
 
439 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  25.4 
 
 
457 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2559  hypothetical protein  23.91 
 
 
418 aa  78.2  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10471  putative modulator of DNA gyrase  24.76 
 
 
462 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0348305  hitchhiker  0.00321513 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2275  Zn-dependent protease and their inactivated protein-like protein  26.07 
 
 
465 aa  77  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000955106  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.35 
 
 
448 aa  77  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0390  microcin-processing peptidase 1  29.82 
 
 
444 aa  76.6  0.0000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.248859  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  24.82 
 
 
463 aa  76.6  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3720  hypothetical protein  27.71 
 
 
448 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0288  hypothetical protein  36.19 
 
 
509 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0776  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.52 
 
 
437 aa  75.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.58521  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.25 
 
 
469 aa  75.9  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0916  microcin-processing peptidase 1  21.79 
 
 
447 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0214325  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.17 
 
 
448 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.334504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4823  hypothetical protein  27.23 
 
 
439 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0183457  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0352  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.86 
 
 
452 aa  75.1  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.678191  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0365  putative modulator of DNA gyrase  24.03 
 
 
462 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0650  pmbA protein  27.2 
 
 
448 aa  74.3  0.000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.501682  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0313  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.43 
 
 
428 aa  73.9  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>