137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1758 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1758  DTW domain containing protein  100 
 
 		 227 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.370644  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1957  DTW domain-containing protein  97.36 
 
 		 227 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  56.94 
 
 		 212 aa  195  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0945  DTW domain-containing protein  53.5 
 
 		 215 aa  188  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0983717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0091  DTW domain-containing protein  50.98 
 
 		 215 aa  148  8e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0863  DTW  40.5 
 
 		 198 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0676  hypothetical protein  42.31 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390701  unclonable  0.0000000107509 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3314  hypothetical protein  41.55 
 
 		 201 aa  118  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  44.21 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  39 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  41.41 
 
 		 199 aa  111  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  42.16 
 
 		 197 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  40.88 
 
 		 199 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  41.99 
 
 		 197 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  35.15 
 
 		 223 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  35.32 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0889  DTW domain-containing protein  29.61 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  37.3 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  31.16 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  38.12 
 
 		 199 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  38.12 
 
 		 199 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  39.39 
 
 		 199 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  38.12 
 
 		 199 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  33.88 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2149  DTW domain-containing protein  32.35 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  36.81 
 
 		 241 aa  96.3  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  31.84 
 
 		 197 aa  94.7  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  38.89 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  32.4 
 
 		 204 aa  94.7  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3914  hypothetical protein  37.37 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  33.51 
 
 		 188 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  32.34 
 
 		 207 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  32.34 
 
 		 207 aa  92  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  33.51 
 
 		 188 aa  91.7  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  31.84 
 
 		 207 aa  91.7  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  33.16 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  28.5 
 
 		 194 aa  90.1  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  29.35 
 
 		 201 aa  88.6  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4292  DTW domain-containing protein  29.21 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.616546  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0317  DTW domain-containing protein  33.15 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  36.15 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2572  hypothetical protein  34.41 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3493  hypothetical protein  33.33 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2561  DTW  31.4 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0180989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2845  DTW domain containing protein  30.33 
 
 		 243 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0255  DTW domain-containing protein  32.95 
 
 		 174 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1899  DTW domain containing protein  34.27 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3935  hypothetical protein  32.71 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1739  DTW domain-containing protein  32.52 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.438659 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2062  hypothetical protein  31.25 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2829  DTW domain-containing protein  27.81 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2899  DTW  29.41 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.124472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1820  DTW domain containing protein  33.64 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4270  DTW domain-containing protein  31.25 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  28.37 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1520  hypothetical protein  29.02 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0474866  normal  0.0473662 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  30.81 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  27.78 
 
 		 254 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  27.78 
 
 		 254 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  27.78 
 
 		 254 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  27.78 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  28.96 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  27.83 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2401  DTW domain-containing protein  34.3 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_93924  predicted protein  30.29 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0426424 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01424  hypothetical protein  31.54 
 
 		 171 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3422  hypothetical protein  28.7 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1429  hypothetical protein  34.07 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  26.07 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  26.92 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  25.93 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  25.4 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0179  DTW  27.14 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.165291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  26.32 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  25.93 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  25.4 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  27.81 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  25.93 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  25.4 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  25.4 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  25.4 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  26.56 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  30.06 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  24.51 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2099  DTW domain-containing protein  26.42 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1229  DTW domain-containing protein  28.99 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  24.6 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  24.6 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  25.94 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  24.6 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  24.73 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02075  hypothetical cytosolic protein  26.14 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3314  DTW domain containing protein  26.47 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  28.11 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2431  DTW domain containing protein  34.25 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  28.24 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2518  DTW domain containing protein  33.7 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  24.48 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  24.48 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  27.17 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>