More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3474 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3474  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
399 aa  798    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  38.13 
 
 
400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1922  protein of unknown function DUF214  32.99 
 
 
400 aa  202  9e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1562  hypothetical protein  31.44 
 
 
403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00597787  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  31.7 
 
 
395 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0166  hypothetical protein  31.3 
 
 
395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1518  permease, putative  30.14 
 
 
403 aa  153  5.9999999999999996e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000418137  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0625  ABC-type transport system for lysophospholipase L1 biosynthesis permease  27.14 
 
 
405 aa  144  4e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0260119  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3893  protein of unknown function DUF214  27.59 
 
 
406 aa  127  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0367  efflux ABC transporter, permease protein  25.71 
 
 
403 aa  113  7.000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2015  hypothetical protein  27.32 
 
 
411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0449562 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  24.26 
 
 
386 aa  92  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  25.43 
 
 
386 aa  87  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  24.88 
 
 
387 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  25.87 
 
 
386 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  25.12 
 
 
386 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  21.25 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  22.76 
 
 
386 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  24.88 
 
 
386 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  28.49 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  32.33 
 
 
413 aa  72  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  25.44 
 
 
386 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  26.21 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  22.65 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  31.69 
 
 
715 aa  69.7  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  24.94 
 
 
386 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  26.77 
 
 
407 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  38.68 
 
 
408 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  24.38 
 
 
394 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  39.45 
 
 
437 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  26.13 
 
 
413 aa  66.2  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  31.06 
 
 
488 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0086  hypothetical protein  28.67 
 
 
438 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  23.79 
 
 
843 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  24.81 
 
 
385 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0895  hypothetical protein  25.42 
 
 
387 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0198854  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  28.17 
 
 
397 aa  64.7  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2953  protein of unknown function DUF214  35.71 
 
 
406 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  23.91 
 
 
389 aa  64.7  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  36.36 
 
 
397 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1678  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  32 
 
 
421 aa  64.3  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0156822  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  29.45 
 
 
454 aa  63.9  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0078  hypothetical protein  32.35 
 
 
404 aa  63.9  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000923125  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  26.97 
 
 
402 aa  62.8  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  25.35 
 
 
859 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  38.68 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2105  protein of unknown function DUF214  28.43 
 
 
462 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00482864  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  38.3 
 
 
856 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  35.19 
 
 
411 aa  62  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4095  hypothetical protein  27.35 
 
 
406 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.591324  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  23.1 
 
 
397 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  26.67 
 
 
842 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  26.75 
 
 
397 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60780  ABC transporter permease  25.83 
 
 
397 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  27.18 
 
 
431 aa  60.8  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  24.55 
 
 
411 aa  60.5  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.92 
 
 
420 aa  60.1  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  25.68 
 
 
397 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  22.67 
 
 
396 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  22.28 
 
 
423 aa  60.1  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  26.09 
 
 
391 aa  60.1  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  31.36 
 
 
379 aa  60.1  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  26.25 
 
 
409 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  29.69 
 
 
857 aa  59.7  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  29.32 
 
 
381 aa  59.7  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  24.15 
 
 
430 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  23.46 
 
 
371 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  36.79 
 
 
404 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  23.53 
 
 
389 aa  59.3  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2395  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family protein  23.98 
 
 
413 aa  59.3  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  24.03 
 
 
854 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_004310  BR0823  ABC transporter, permease protein  32.89 
 
 
422 aa  58.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395922  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  25.96 
 
 
414 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  36.79 
 
 
404 aa  58.9  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  29.15 
 
 
409 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0817  ABC transporter, permease protein  32.89 
 
 
413 aa  58.9  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  22.37 
 
 
395 aa  58.2  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  30.4 
 
 
397 aa  58.9  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  26.58 
 
 
452 aa  58.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  32.89 
 
 
409 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0681  permease, putative  26.98 
 
 
421 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  32.8 
 
 
841 aa  58.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  23.17 
 
 
397 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5233  ABC transporter permease  25.4 
 
 
397 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  30.07 
 
 
406 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  32.89 
 
 
410 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  27.86 
 
 
405 aa  57.4  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  32.89 
 
 
410 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  25.57 
 
 
387 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3157  ABC transporter permease  19.5 
 
 
684 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.214324  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  26.97 
 
 
397 aa  56.6  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  32.89 
 
 
398 aa  56.6  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  28.11 
 
 
407 aa  56.6  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2606  hypothetical protein  24.01 
 
 
420 aa  56.6  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000189226  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  28.97 
 
 
408 aa  56.6  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  28.9 
 
 
848 aa  56.6  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  28.8 
 
 
390 aa  56.6  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  31.13 
 
 
404 aa  56.6  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  31.82 
 
 
414 aa  56.6  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  31.13 
 
 
847 aa  56.2  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>