More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0418 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  833    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  57.88 
 
 		 410 aa  478  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  40.39 
 
 		 411 aa  279  7e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  34.65 
 
 		 723 aa  227  3e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  32.76 
 
 		 404 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  31.22 
 
 		 409 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  31.39 
 
 		 412 aa  204  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  33.25 
 
 		 543 aa  196  5.000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  31.25 
 
 		 399 aa  191  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.88 
 
 		 405 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  30.71 
 
 		 402 aa  170  5e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  31.73 
 
 		 420 aa  135  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  33.22 
 
 		 418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  28.43 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  29.75 
 
 		 425 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  25.36 
 
 		 398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  27.88 
 
 		 395 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  31.01 
 
 		 424 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  31.03 
 
 		 424 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  32.18 
 
 		 424 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  30.72 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  26.1 
 
 		 437 aa  101  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.15 
 
 		 407 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  32.17 
 
 		 410 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.62 
 
 		 410 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  21.15 
 
 		 407 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  21.15 
 
 		 407 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  30.24 
 
 		 413 aa  90.1  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  31.85 
 
 		 414 aa  89.7  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  29.17 
 
 		 411 aa  89.7  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  27.94 
 
 		 428 aa  87.8  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  30.02 
 
 		 900 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  31.8 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  30.02 
 
 		 914 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  30.02 
 
 		 900 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1584  putative carbamoyl-phosphate-synthetase protein  25.52 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  29.27 
 
 		 756 aa  84.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.95 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  28.68 
 
 		 891 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.01 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1007  hypothetical protein  31.75 
 
 		 427 aa  80.5  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  28.5 
 
 		 924 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1268  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.13 
 
 		 400 aa  79  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.584392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  28.12 
 
 		 926 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  26.91 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  27.71 
 
 		 912 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  27.83 
 
 		 894 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  27.45 
 
 		 896 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  27.85 
 
 		 904 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6391  phosphoribosylglycinamide synthetase  31.33 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782672  normal  0.167257 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  27.85 
 
 		 904 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.53 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  25.65 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  30.1 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3552  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein  26.06 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.272734 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  31.73 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  31.73 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.87 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1553  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp, putative  25.37 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  28.96 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  27.56 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.66 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  23.82 
 
 		 401 aa  66.2  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  22.73 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1917  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.47 
 
 		 1065 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3245  hypothetical protein  22.66 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.837509  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  26.85 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  28.74 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.09 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1710  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.07 
 
 		 1136 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485747 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2612  D-alanine--D-alanine ligase  27.59 
 
 		 317 aa  62.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000431315  unclonable  0.00000000000418412 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2329  D-alanine--D-alanine ligase  28.63 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.304126  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2986  carbamoyl-phosphate synthase large chain  21.7 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.556183  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1077  D-alanine--D-alanine ligase  33.62 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0742794  normal  0.822876 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0183  D-alanine--D-alanine ligase  29.26 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000736036  normal  0.566039 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  24 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1787  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.47 
 
 		 621 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  30 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  29.09 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  25.95 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0072  hypothetical protein  29.92 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4142  hypothetical protein  29.92 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16964  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  26.18 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  24.81 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6363  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  27.37 
 
 		 450 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21371  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3198  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.25 
 
 		 1130 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00397433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1472  D-alanine--D-alanine ligase  28.32 
 
 		 326 aa  59.7  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0261  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  22.77 
 
 		 1064 aa  58.9  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1207  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.08 
 
 		 1059 aa  59.3  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03057  hypothetical protein  25.74 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2038  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  27.08 
 
 		 1109 aa  58.9  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373357 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14410  carbamoylphosphate synthase large subunit  23.76 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5241  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  29.38 
 
 		 1099 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560222  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0767  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.74 
 
 		 1073 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.256868  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0060  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25 
 
 		 1065 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  28.62 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001066  vibrioferrin ligase/carboxylase protein PvsA  24.27 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  28.43 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  26.25 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4090  hypothetical protein  31.29 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.572464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>