More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2676 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2676  UspA domain protein  100 
 
 		 142 aa  283  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  89.44 
 
 		 143 aa  257  5.0000000000000005e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2532  UspA domain protein  73.94 
 
 		 142 aa  217  6e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2836  UspA domain protein  74.65 
 
 		 142 aa  216  8.999999999999998e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1834  UspA domain-containing protein  69.72 
 
 		 142 aa  203  8e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0628  universal stress protein G  47.22 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0693  universal stress protein G  47.22 
 
 		 142 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.727878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0628  universal stress protein G  47.22 
 
 		 142 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0659  universal stress protein G  47.22 
 
 		 142 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00576  universal stress protein UP12  47.22 
 
 		 142 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3017  UspA domain protein  47.22 
 
 		 142 aa  128  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1115  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3036  UspA domain-containing protein  47.22 
 
 		 142 aa  128  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00565  hypothetical protein  47.22 
 
 		 142 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0521  universal stress protein G  46.53 
 
 		 142 aa  127  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4244  UspA domain-containing protein  44.83 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1147  UspA domain-containing protein  43.06 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.280901 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1502  universal stress protein F  41.5 
 
 		 144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432099  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1773  universal stress protein F  41.5 
 
 		 144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.633651  normal  0.0944552 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1771  universal stress protein F  41.5 
 
 		 144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0837729 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1834  universal stress protein F  41.5 
 
 		 144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1685  universal stress protein F  41.5 
 
 		 144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1777  universal stress protein F  42.18 
 
 		 144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1613  universal stress protein F  42.18 
 
 		 144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1994  universal stress protein F  42.18 
 
 		 144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.845186 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01347  stress-induced protein, ATP-binding protein  42.18 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2270  UspA domain protein  42.18 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397995  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01359  hypothetical protein  42.18 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1559  universal stress protein F  41.5 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2280  UspA domain-containing protein  42.18 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1937  UspA domain-containing protein  39.16 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1462  universal stress protein F  42.18 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.694319  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2566  UspA domain-containing protein  41.26 
 
 		 143 aa  110  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31142  normal  0.160987 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1327  hypothetical protein  37.24 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5541  putative universal stress protein (Usp)  36.62 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1477  hypothetical protein  38.73 
 
 		 141 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41182  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  36.62 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3824  hypothetical protein  35.21 
 
 		 143 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0179  hypothetical protein  37.76 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1445  UspA domain protein  36.05 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228504  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0712  universal stress protein G  41.24 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.9695 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0726  universal stress protein G  41.24 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.678292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2329  hypothetical protein  37.06 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0772  universal stress protein G  41.24 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0667  universal stress protein G  41.24 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.576414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0653  universal stress protein G  41.24 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  32.39 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0609  hypothetical protein  36.36 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0479495  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0031  UspA domain protein  34.03 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3802  hypothetical protein  36.81 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.356211  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3481  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3686  hypothetical protein  34.01 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.460591 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2040  putative universal stress protein  35.66 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.190459  normal  0.175544 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  33.75 
 
 		 177 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  39.6 
 
 		 154 aa  67  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2686  universal stress protein  35.21 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0810478  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  31.94 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  30.56 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  34.46 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  31.76 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  31.72 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1497  hypothetical protein  29.86 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1486  hypothetical protein  29.86 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  29.17 
 
 		 288 aa  60.5  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  33.59 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  32.87 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  31.51 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  31.33 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  31.85 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2734  universal stress protein  52.73 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  31.51 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1265  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  36.49 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1250  hypothetical protein  30.07 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.284687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  30.07 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  30.34 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  31.69 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3293  hypothetical protein  34.72 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  31.69 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  31.79 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  31.76 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  29.33 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  26.57 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2132  universal stress protein  31.69 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0989997 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  28.86 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  29.73 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  28.77 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  31.21 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  28.29 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2213  putative UspA domain protein  28.47 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>