More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2695 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  100 
 
 		 504 aa  1035    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  35.43 
 
 		 462 aa  237  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  32.2 
 
 		 469 aa  224  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  37.7 
 
 		 629 aa  221  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  33.62 
 
 		 459 aa  217  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  34.92 
 
 		 475 aa  211  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1623  helicase domain-containing protein  30.54 
 
 		 502 aa  202  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  33.7 
 
 		 581 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2849  type III restriction enzyme, res subunit  31.75 
 
 		 512 aa  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11338  hypothetical protein  30.97 
 
 		 503 aa  139  8.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  26.41 
 
 		 560 aa  139  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4439  type III restriction protein res subunit  31.78 
 
 		 510 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226232  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  27.96 
 
 		 560 aa  137  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  26.84 
 
 		 560 aa  134  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  26.41 
 
 		 560 aa  134  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  26.62 
 
 		 560 aa  134  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  27.34 
 
 		 538 aa  134  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  29.56 
 
 		 536 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  26.62 
 
 		 560 aa  134  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  29.2 
 
 		 574 aa  133  9e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  29.41 
 
 		 550 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  28.43 
 
 		 545 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  28.57 
 
 		 585 aa  131  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  28.33 
 
 		 583 aa  130  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  28.99 
 
 		 583 aa  130  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  28.3 
 
 		 545 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  28.54 
 
 		 569 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  28.91 
 
 		 584 aa  127  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  29.74 
 
 		 586 aa  127  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  29.6 
 
 		 584 aa  126  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  30.66 
 
 		 773 aa  126  9e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  29.5 
 
 		 586 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  29.51 
 
 		 602 aa  126  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  29.86 
 
 		 585 aa  126  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  29.5 
 
 		 586 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  29.7 
 
 		 584 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  28.81 
 
 		 590 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  29.7 
 
 		 584 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  29.5 
 
 		 586 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  28.77 
 
 		 590 aa  125  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  29.23 
 
 		 590 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  29.67 
 
 		 586 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.23 
 
 		 657 aa  124  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  28.92 
 
 		 586 aa  124  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  29.47 
 
 		 584 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  29.5 
 
 		 586 aa  123  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  29.5 
 
 		 586 aa  123  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  29.5 
 
 		 586 aa  123  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  29.5 
 
 		 586 aa  123  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  29.5 
 
 		 586 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  29.5 
 
 		 586 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  28.14 
 
 		 590 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  29.5 
 
 		 586 aa  121  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  29.12 
 
 		 585 aa  121  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  28.5 
 
 		 586 aa  121  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  28.43 
 
 		 586 aa  121  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  29.26 
 
 		 586 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  29.12 
 
 		 585 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  29.12 
 
 		 585 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  28.23 
 
 		 586 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  28.13 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  26.99 
 
 		 545 aa  118  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  30.07 
 
 		 586 aa  116  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  27.38 
 
 		 591 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  27.87 
 
 		 597 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  27.82 
 
 		 580 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8690  putative helicase  28.73 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  29.71 
 
 		 607 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  26.98 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  29.67 
 
 		 588 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  27.87 
 
 		 580 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  27.23 
 
 		 616 aa  109  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1475  type I restriction-modification system, R subunit  27.87 
 
 		 761 aa  108  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  28.27 
 
 		 613 aa  108  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  27.44 
 
 		 579 aa  107  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  28.36 
 
 		 524 aa  107  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  25.18 
 
 		 706 aa  107  6e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  29.46 
 
 		 606 aa  107  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  27.14 
 
 		 580 aa  106  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  26.09 
 
 		 583 aa  106  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  28.3 
 
 		 1287 aa  102  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0307  Type III restriction enzyme, res subunit  28.25 
 
 		 539 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0435132  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3748  ABC-type metal ion transport system ATPase component-like protein  33.03 
 
 		 229 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.671245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4882  type I restriction enzyme EcoEI R protein  25.75 
 
 		 809 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  26.17 
 
 		 643 aa  97.8  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  27.56 
 
 		 1063 aa  95.9  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3273  hypothetical protein  26.17 
 
 		 776 aa  94.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  24.88 
 
 		 1062 aa  94.4  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2499  DEAD/DEAH box helicase-like  25.13 
 
 		 793 aa  93.6  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0539678  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3028  hypothetical protein  24.62 
 
 		 796 aa  92.8  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194288  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  26.35 
 
 		 967 aa  93.2  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1976  EcoEI R domain-containing protein  27.88 
 
 		 825 aa  90.5  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.411939  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6047  type I restriction-modification system subunit R  26.13 
 
 		 788 aa  90.5  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.494965  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1302  putative helicase  31.13 
 
 		 516 aa  89.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3086  Type I site-specific deoxyribonuclease  24.38 
 
 		 813 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.461628  normal  0.442211 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  26.04 
 
 		 1418 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  25.52 
 
 		 812 aa  89.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4740  type I restriction-modification system, R subunit  26.07 
 
 		 787 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141278 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  26.71 
 
 		 1051 aa  89  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  25.88 
 
 		 1043 aa  89  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>