More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1450 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1450  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 440 aa  867    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  43.24 
 
 		 444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468182  normal  0.167582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  40.67 
 
 		 328 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  40.67 
 
 		 320 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  39.71 
 
 		 320 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  38.66 
 
 		 375 aa  125  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  38.14 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  40 
 
 		 327 aa  111  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  40.47 
 
 		 326 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2777  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  41.1 
 
 		 171 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.933443 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  37.5 
 
 		 274 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4751  anti-FecI sigma factor, FecR  34.94 
 
 		 344 aa  103  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  0.56762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  38.46 
 
 		 268 aa  103  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  38.28 
 
 		 345 aa  103  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  30.56 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  36.15 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  30.56 
 
 		 374 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  44.24 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  37.56 
 
 		 326 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  37.56 
 
 		 326 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  28.99 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  38.42 
 
 		 325 aa  97.8  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  34.89 
 
 		 318 aa  97.8  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  37.02 
 
 		 280 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3327  anti-FecI sigma factor, FecR  31.31 
 
 		 327 aa  97.1  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  34.15 
 
 		 357 aa  96.3  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  34.27 
 
 		 331 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  38.73 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  38.46 
 
 		 317 aa  94  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  39.06 
 
 		 327 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  40.4 
 
 		 327 aa  94  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  36.82 
 
 		 337 aa  93.6  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  36.49 
 
 		 329 aa  92.4  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01110  Anti-sigma factor, FecR family  33.86 
 
 		 313 aa  92.8  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  33.04 
 
 		 342 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  38.01 
 
 		 333 aa  92.8  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3958  putative regulatory protein  33.95 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  40.99 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2952  anti-FecI sigma factor, FecR  35.68 
 
 		 319 aa  92.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633834 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1050  putative FecR  35.42 
 
 		 318 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  36.69 
 
 		 331 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  36.05 
 
 		 324 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  38.83 
 
 		 328 aa  91.3  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  40.23 
 
 		 331 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  33.75 
 
 		 320 aa  90.1  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  31.82 
 
 		 342 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1225  FecR protein  30.1 
 
 		 319 aa  89.7  9e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.615104  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  38.18 
 
 		 329 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  33.48 
 
 		 319 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1645  RNA polymerase sigma factor  37.35 
 
 		 158 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22640  Anti-sigma factor protein, FecR family  32.29 
 
 		 317 aa  88.6  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  36.36 
 
 		 342 aa  89  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1858  RNA polymerase sigma factor  34.52 
 
 		 160 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.598111  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2388  anti-FecI sigma factor, FecR  40.13 
 
 		 308 aa  88.2  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.514905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  31.94 
 
 		 335 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  28.67 
 
 		 315 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0744  fec operon regulator FecR  33.68 
 
 		 317 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117429  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  35.32 
 
 		 328 aa  87.4  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04158  transmembrane signal transducer for ferric citrate transport  33.68 
 
 		 317 aa  87  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3708  anti-FecI sigma factor, FecR  33.68 
 
 		 317 aa  87  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  31.94 
 
 		 335 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0605  anti-FecI sigma factor, FecR  30.41 
 
 		 325 aa  87  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04121  hypothetical protein  33.68 
 
 		 317 aa  87  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0694  anti-FecI sigma factor, FecR  32.52 
 
 		 318 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  27.88 
 
 		 336 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2144  anti-FecI sigma factor, FecR  36.32 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.634056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1438  sigma-24 (FecI)  36.81 
 
 		 173 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  30.81 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4869  fec operon regulator FecR  33.68 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  31.48 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  36.77 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  32.41 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3603  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  37.91 
 
 		 173 aa  84  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.324027 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  35.29 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  36.21 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  34.26 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  32.52 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4208  RNA polymerase sigma factor  37.58 
 
 		 158 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.506383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  30.88 
 
 		 333 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0996  anti-FecI sigma factor, FecR  27.87 
 
 		 315 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  31.94 
 
 		 342 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  32.56 
 
 		 264 aa  82  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0909  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.58 
 
 		 165 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619138 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0746  anti-FecI sigma factor, FecR  33.63 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0737  anti-FecI sigma factor, FecR  30.6 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  31.92 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  39.3 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3780  RNA polymerase sigma factor  35.29 
 
 		 158 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  30.24 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0895  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.62 
 
 		 165 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.248298 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  37 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0865  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.62 
 
 		 161 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3275  anti-FecI sigma factor, FecR  33.62 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3532  RNA polymerase sigma factor  35.09 
 
 		 158 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.997042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2873  RNA polymerase sigma factor  35.71 
 
 		 159 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.511965  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  33.47 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3504  anti-FecI sigma factor, FecR  33.5 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  35.08 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03870  RNA polymerase sigma factor, FecI family  30.51 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.943844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1809  anti-FecI sigma factor, FecR  34.67 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>