More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3059 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  100 
 
 
418 aa  860    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0426  Radical SAM domain protein  67.65 
 
 
420 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  65.85 
 
 
423 aa  585  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  65.6 
 
 
423 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2953  Radical SAM domain protein  49.21 
 
 
439 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  47.8 
 
 
491 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  47.8 
 
 
491 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  47.8 
 
 
491 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  47.8 
 
 
491 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  47.8 
 
 
491 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  47.8 
 
 
491 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  47.8 
 
 
491 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  46.58 
 
 
491 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  45.55 
 
 
482 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  46.6 
 
 
491 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  44.44 
 
 
487 aa  351  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  34.13 
 
 
510 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  34.12 
 
 
347 aa  194  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  32.45 
 
 
360 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  33.04 
 
 
383 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  29.49 
 
 
414 aa  150  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  30.66 
 
 
349 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  30.29 
 
 
347 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 
399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  28.93 
 
 
363 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  30.97 
 
 
335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  27.38 
 
 
501 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  30.75 
 
 
346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  27.87 
 
 
347 aa  129  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 
405 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  27.7 
 
 
330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  26.12 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  28.12 
 
 
479 aa  127  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.45 
 
 
397 aa  126  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  29.13 
 
 
381 aa  125  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  27.48 
 
 
496 aa  125  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  26.72 
 
 
359 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  28.07 
 
 
333 aa  124  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  28.32 
 
 
358 aa  123  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  26.54 
 
 
399 aa  123  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  30.59 
 
 
377 aa  122  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  30.9 
 
 
349 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  27.4 
 
 
366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  26.62 
 
 
413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  25.96 
 
 
330 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.19 
 
 
394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  25.3 
 
 
330 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  27.13 
 
 
333 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 
391 aa  117  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  27.54 
 
 
389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  30.37 
 
 
356 aa  117  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  27.54 
 
 
377 aa  116  6e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2660  Fe-S oxidoreductase, putative coenzyme synthesis protein  28.48 
 
 
344 aa  116  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  26.91 
 
 
480 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  27.45 
 
 
380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  26.74 
 
 
354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  29.65 
 
 
367 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  27.75 
 
 
380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  25.87 
 
 
356 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  26.82 
 
 
380 aa  114  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 
398 aa  114  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  25.87 
 
 
356 aa  113  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  24.31 
 
 
375 aa  113  7.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  27.08 
 
 
332 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  25.53 
 
 
397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  23.66 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  24.57 
 
 
361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 
393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  28.25 
 
 
375 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 
394 aa  110  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  27.91 
 
 
410 aa  110  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  27.85 
 
 
396 aa  109  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  33.12 
 
 
396 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  27.88 
 
 
353 aa  109  8.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  28.99 
 
 
405 aa  109  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  23.22 
 
 
358 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  26.82 
 
 
418 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  25.66 
 
 
382 aa  109  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  28.86 
 
 
409 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  24.38 
 
 
429 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  26.72 
 
 
368 aa  108  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  24.57 
 
 
399 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  25.66 
 
 
355 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  23.22 
 
 
358 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  25 
 
 
327 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17970  predicted Fe-S oxidoreductase  27.05 
 
 
356 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  24.62 
 
 
368 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  24.13 
 
 
404 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  27.46 
 
 
409 aa  107  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  23.15 
 
 
428 aa  107  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  22.86 
 
 
397 aa  107  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  24.8 
 
 
358 aa  107  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 
406 aa  107  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  26.02 
 
 
405 aa  106  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  25.99 
 
 
406 aa  106  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  33.94 
 
 
391 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  26.27 
 
 
418 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  27.83 
 
 
373 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  27.32 
 
 
395 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0595995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>