More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4068 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 484 aa  916    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  41.21 
 
 		 491 aa  266  8e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  36.51 
 
 		 488 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  35.65 
 
 		 678 aa  225  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  33.2 
 
 		 485 aa  218  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 		 474 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  36.57 
 
 		 457 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  35.68 
 
 		 476 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 		 494 aa  208  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  34.4 
 
 		 485 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5903  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 		 487 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5354  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.35 
 
 		 449 aa  201  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759907  normal  0.552203 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 		 487 aa  197  3e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0629  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 		 499 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  38.22 
 
 		 474 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 523 aa  186  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4784  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 		 498 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122812  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1789  major facilitator superfamily MFS_1  36.19 
 
 		 512 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 		 482 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3936  major facilitator transporter  33.79 
 
 		 650 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7073  Arabinose efflux permease-like protein  33.79 
 
 		 492 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2262  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 484 aa  179  8e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000865567  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 475 aa  178  2e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  34.41 
 
 		 500 aa  177  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1765  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 471 aa  174  5e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.719018  decreased coverage  0.000452829 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 472 aa  172  9e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3385  major facilitator superfamily transporter  34.36 
 
 		 489 aa  172  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3140  major facilitator transporter  34.84 
 
 		 479 aa  172  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 464 aa  169  7e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 643 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  32.3 
 
 		 643 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 643 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 491 aa  168  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6965  major facilitator transporter  34.33 
 
 		 548 aa  168  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.69368  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 503 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00710  arabinose efflux permease family protein  32.33 
 
 		 487 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.909323  normal  0.190181 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 477 aa  164  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 		 482 aa  163  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2569  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 487 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2614  major facilitator superfamily transporter  34.1 
 
 		 487 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 477 aa  159  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1004  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 473 aa  159  1e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2608  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 487 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 502 aa  157  3e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  34.47 
 
 		 483 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3651  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 517 aa  153  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  32.04 
 
 		 477 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.47 
 
 		 569 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1811  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 492 aa  147  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3397  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 504 aa  146  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0887  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 494 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 473 aa  144  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2255  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 		 480 aa  143  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.96 
 
 		 521 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.82 
 
 		 468 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.86 
 
 		 517 aa  140  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.4 
 
 		 522 aa  140  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2371  major facilitator superfamily MFS_1  34.37 
 
 		 472 aa  140  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.130486  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.37 
 
 		 672 aa  139  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.12 
 
 		 535 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.37 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.75 
 
 		 517 aa  137  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.07 
 
 		 565 aa  137  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.32 
 
 		 593 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.12 
 
 		 537 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.62 
 
 		 666 aa  134  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.31 
 
 		 520 aa  133  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.57 
 
 		 508 aa  133  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.86 
 
 		 539 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.94 
 
 		 519 aa  133  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2303  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 		 463 aa  133  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.42 
 
 		 676 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.6 
 
 		 514 aa  131  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.29 
 
 		 475 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.8 
 
 		 517 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.72 
 
 		 515 aa  130  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 515 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.84 
 
 		 493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.3 
 
 		 515 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2919  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.3 
 
 		 508 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.06 
 
 		 504 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.81 
 
 		 495 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  29.2 
 
 		 1062 aa  128  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.61 
 
 		 534 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1282  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.82 
 
 		 530 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139522  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.82 
 
 		 530 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.04 
 
 		 522 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.95 
 
 		 504 aa  127  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.1 
 
 		 579 aa  127  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.4 
 
 		 528 aa  127  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 		 697 aa  126  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.9 
 
 		 539 aa  126  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.59 
 
 		 530 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.37 
 
 		 500 aa  126  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.81 
 
 		 495 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.65 
 
 		 525 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.65 
 
 		 558 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.770491 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.49 
 
 		 524 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.97 
 
 		 621 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>