76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2218 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2218  regulatory protein TetR  100 
 
 		 216 aa  413  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0300216  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3670  hypothetical protein  34.21 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3471  hypothetical protein  34.21 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3344  hypothetical protein  34.21 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1491  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  38.3 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3105  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  51.67 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 304 aa  53.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  43.3 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  30.74 
 
 		 255 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 272 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  29.21 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 229 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 267 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 271 aa  49.3  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 246 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  36.27 
 
 		 342 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6279  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 235 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1527  transcriptional regulator, TetR family  43.02 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 258 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0040  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 195 aa  45.8  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 266 aa  45.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 263 aa  45.1  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 268 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  44.19 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3560  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  23.96 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 278 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 267 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6339  transcriptional regulator, TetR family  47.89 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  29.95 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5002  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.827142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 230 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  29.95 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4913  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.763615  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 285 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  29.95 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  27.31 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5281  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2515  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 238 aa  42.4  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.745235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1502  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385487  normal  0.318035 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  32.69 
 
 		 190 aa  42  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0472  putative transcription regulator protein  35.21 
 
 		 213 aa  42.4  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.19326  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 343 aa  42  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 190 aa  42  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 343 aa  41.6  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  25.33 
 
 		 228 aa  41.6  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 214 aa  41.6  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>