More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1509 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1509  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 191 aa  376  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0925  transcriptional regulator, XRE family  38.04 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  26.44 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2042  transcriptional regulator  31.05 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  32.04 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  32.56 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0127  transcriptional regulator, XRE family  32.95 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  29.67 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  25.71 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1729  transcriptional regulator, XRE family  27.93 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114176  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2094  transcriptional regulator Cro/CI family protein  24.12 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  27.33 
 
 		 175 aa  67  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3161  XRE family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1721  XRE family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 201 aa  67  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0685  Cro/CI family transcriptional regulator  21.39 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  31.93 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2066  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  26.01 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  29.65 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2948  transcriptional regulator, XRE family  26.83 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211039  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01276  DNA-binding transcriptional repressor  24.56 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2347  transcriptional regulator, XRE family  24.56 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.204857  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1823  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  24.56 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0706879 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01287  hypothetical protein  24.56 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1509  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  24.56 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1535  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  24.56 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0766  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4834  transcriptional regulator, XRE family  30.23 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.197047  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2326  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  24.56 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1414  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  24.56 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  27.43 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.44 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1941  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  24.56 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.385308 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0898  XRE family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0105  DNA-binding protein  25.86 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5523  transcriptional regulator  26.29 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2919  transcriptional regulator, XRE family  25.47 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1180  helix-turn-helix domain-containing protein  20.56 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1306  transcriptional regulator, XRE family  25.47 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000237827 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1158  XRE family transcriptional regulator  20.56 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000119717  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  30.67 
 
 		 269 aa  61.6  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3217  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  25.58 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3869  XRE family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1443  XRE family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4768  XRE family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.2486  normal  0.289686 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  25.15 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4784  transcriptional regulator, XRE family  29.65 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0510271 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0925  transcriptional regulator, putative  29.19 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0867  putative transcriptional regulator  29.19 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0318952  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3411  transcriptional regulator, XRE family  28.95 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  29.71 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4679  putative transcriptional regulator  24.59 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0277  XRE family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.128046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0544  XRE family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1088  transcriptional regulator  26.8 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0981  DNA-binding protein  26.8 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2734  XRE family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00297691  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  30.34 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47950  Cupin, RmlC-type protein  28.41 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2025  aldehyde dehydrogenase-like protein  27.84 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69980  putative transcriptional regulator  25.86 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  25.71 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 191 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1943  Cro/CI family transcriptional regulator putative  27.72 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.693839  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  25.71 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  25.71 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0641  aldehyde dehydrogenase-like protein  27.87 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1077  XRE family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0248  XRE family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6075  putative transcriptional regulator  25.86 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0733  aldehyde dehydrogenase-like protein  27.87 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126553  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  22.35 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  27.49 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1468  transcriptional regulator, XRE family  25.97 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0100935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>