More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1818 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1818  peptidase M23B  100 
 
 		 286 aa  571  1.0000000000000001e-162  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  31.58 
 
 		 230 aa  91.7  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1862  putative lipoprotein NlpD  31.58 
 
 		 230 aa  91.3  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  24.1 
 
 		 301 aa  90.1  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  32.07 
 
 		 262 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  29.17 
 
 		 602 aa  89.7  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  32.07 
 
 		 262 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1428  peptidase M23B  33.17 
 
 		 245 aa  90.1  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  31.36 
 
 		 285 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1663  putative lipoprotein  34.47 
 
 		 262 aa  89  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.79194  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  33.61 
 
 		 293 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  31.44 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  27.59 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  27.97 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  32.23 
 
 		 230 aa  85.5  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  30.77 
 
 		 270 aa  85.5  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  29.82 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4989  Peptidase M23  32.54 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0293299  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  26.6 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  28.09 
 
 		 430 aa  83.2  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1037  peptidase M23B  31.65 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.283686 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  32.5 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  33.47 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4720  peptidase M23B  32.18 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.887961  normal  0.0183051 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  31.6 
 
 		 238 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1073  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  33.66 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  32.43 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  28.52 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  29.61 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  31.08 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  32.38 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  27.03 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  29.62 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  29.62 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  30.38 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  29.58 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1461  Peptidase M23  27.94 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  29.74 
 
 		 292 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1299  peptidase M23B  30 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  28.45 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  28.77 
 
 		 236 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  32.39 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  29.18 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1756  peptidase M23B  28.44 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657093  decreased coverage  0.0000000551494 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  29.18 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4460  peptidase M23B  30 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  29.18 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3617  peptidase M23B  30.92 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760832 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  29.18 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0836  peptidase M23B  30 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155509  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4456  peptidase M23B  30.92 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  29.18 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4030  peptidase M23B  31.63 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1317  peptidase M23B  30 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3910  peptidase M23B  30.92 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  30.99 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  30.99 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  30.99 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  30.74 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2178  peptidase M23B  30.62 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5969  Peptidase M23  31.9 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  30.99 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4673  peptidase M23B  30.92 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3768  peptidase M23B  29.96 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4600  peptidase M23B  29.96 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204329 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  29.18 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  29.18 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  29.18 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  29.18 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  29.18 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  29.18 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1252  lipoprotein NlpD  27.88 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18696  normal  0.0631891 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2205  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.572382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  30.93 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4956  Peptidase M23  26.2 
 
 		 325 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.0405344 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  27.24 
 
 		 360 aa  75.5  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  28 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  26.09 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0661  peptidase M23B  25.34 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0851983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  28.76 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  28.76 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  40 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  29.2 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  28.63 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65030  hypothetical protein  30.96 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.195389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  22.91 
 
 		 509 aa  73.6  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  28.39 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  28.39 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  29.91 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  28.39 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  28.39 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  27.73 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  39.02 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  28.39 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  28.39 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  38.94 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  28.39 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1246  novel lipoprotein homolog NlpD  29.3 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  26.99 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4488  peptidase M23  29.38 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>