160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4493 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 488 aa  1009    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6678  tryptophan halogenase  36.65 
 
 		 506 aa  269  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  29.13 
 
 		 506 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0318  dehydrogenases (flavoproteins)-like  23.43 
 
 		 482 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.331589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2626  monooxygenase FAD-binding  25.54 
 
 		 356 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3477  dehydrogenase (flavoprotein)  26.49 
 
 		 356 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00015718  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  26.68 
 
 		 401 aa  98.2  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0291  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 		 361 aa  98.2  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2948  monooxygenase FAD-binding  23.36 
 
 		 430 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284077  normal  0.479686 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  25.67 
 
 		 480 aa  91.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  26.12 
 
 		 470 aa  86.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  26.61 
 
 		 444 aa  85.5  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  27.12 
 
 		 491 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2304  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  26.65 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.35 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  26.22 
 
 		 455 aa  80.9  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  26.9 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.93 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  26.92 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25.07 
 
 		 455 aa  79.3  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1705  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  23.37 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3720  FAD dependent oxidoreductase  23.08 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288954 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  25.61 
 
 		 647 aa  76.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 429 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2472  monooxygenase FAD-binding  25.11 
 
 		 430 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  24.21 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  24.21 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  24.82 
 
 		 618 aa  75.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  25.75 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2979  aromatic-ring hydroxylase  25 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  25.14 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  25.75 
 
 		 480 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  25.21 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  25.75 
 
 		 480 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  26.03 
 
 		 480 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  25.75 
 
 		 480 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  22.41 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  24.77 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  25.34 
 
 		 429 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  28.05 
 
 		 409 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  23.48 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  26.59 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  25.34 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  26.59 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  24.54 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  24.79 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  27.07 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  25.47 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  25.71 
 
 		 495 aa  70.1  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  26.11 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  33.6 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  23.62 
 
 		 584 aa  67  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  26.63 
 
 		 409 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  24.63 
 
 		 435 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  25.15 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  30.49 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  24.63 
 
 		 424 aa  66.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2083  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  25.14 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  27.31 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0828  FAD dependent oxidoreductase  23.35 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491479  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  24.71 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  23.99 
 
 		 507 aa  63.5  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  26.5 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  24.33 
 
 		 435 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3529  monooxygenase FAD-binding  23.92 
 
 		 409 aa  63.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174105  decreased coverage  0.00232713 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  37.7 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  25.52 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  23.2 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  25.08 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  24.79 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0759  hypothetical protein  24.25 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  24.45 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  24.78 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  25.15 
 
 		 449 aa  60.1  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1021  FAD dependent oxidoreductase  24.4 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3389  monooxygenase FAD-binding  28.98 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  23.71 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  23.75 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  23.31 
 
 		 587 aa  57.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  22.25 
 
 		 420 aa  57  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  23.1 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  22.6 
 
 		 370 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  23.84 
 
 		 376 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  21.35 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3653  monooxygenase FAD-binding  23.14 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  28.66 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  26.42 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  24.93 
 
 		 416 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  35.25 
 
 		 431 aa  54.3  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2750  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  25.29 
 
 		 366 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.589907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  31.78 
 
 		 423 aa  53.5  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  25.3 
 
 		 387 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4211  monooxygenase FAD-binding  22.57 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747744  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  31.2 
 
 		 435 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  26.78 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>