53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1395 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1395  YD repeat protein  100 
 
 		 1463 aa  3009    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  38.57 
 
 		 2418 aa  784    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4142  hypothetical protein  44.08 
 
 		 1409 aa  1006    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369154  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4225  hypothetical protein  73.57 
 
 		 809 aa  1214    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4386  hypothetical protein  39.14 
 
 		 1179 aa  787    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.241332  decreased coverage  0.00292232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4641  YD repeat protein  66 
 
 		 1461 aa  1718    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32679  hitchhiker  0.00117662 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7099  YD repeat protein  65.76 
 
 		 1480 aa  1727    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00495038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2076  YD repeat protein  35.72 
 
 		 1740 aa  600  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3008  hypothetical protein  45.29 
 
 		 913 aa  562  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3007  hypothetical protein  37.84 
 
 		 503 aa  325  6e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3729  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  31.55 
 
 		 1753 aa  313  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2668  hypothetical protein  31.34 
 
 		 1743 aa  313  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1050  YD repeat-containing protein  31.88 
 
 		 1157 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1098  hypothetical protein  31.69 
 
 		 1172 aa  303  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00467719  unclonable  0.0000000000319304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2123  YD repeat protein  29.54 
 
 		 1073 aa  133  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3613  hypothetical protein  70.59 
 
 		 254 aa  84.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.389609  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4789  YD repeat protein  32.95 
 
 		 2864 aa  72.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3207  RHS repeat-containing protein  27.51 
 
 		 2513 aa  70.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.127821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1525  Rhs family-like protein  26.82 
 
 		 3794 aa  63.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0606  YD repeat-containing protein  37.5 
 
 		 3662 aa  62.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  37.37 
 
 		 2443 aa  54.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  32.35 
 
 		 3456 aa  52.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  42.22 
 
 		 2510 aa  51.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2749  YD repeat protein  26.47 
 
 		 2808 aa  51.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  26.51 
 
 		 1464 aa  51.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  22.89 
 
 		 1352 aa  51.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  25.35 
 
 		 3073 aa  50.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  24.43 
 
 		 1271 aa  50.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  23.2 
 
 		 1576 aa  50.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0513  hypothetical protein  36.26 
 
 		 2843 aa  49.7  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  35.96 
 
 		 2698 aa  49.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4970  YD repeat protein  26.21 
 
 		 1669 aa  48.5  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3664  hypothetical protein  29.37 
 
 		 302 aa  48.5  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375462  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  34.65 
 
 		 886 aa  48.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4454  insecticidal toxin protein, putative  34.02 
 
 		 928 aa  48.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.543889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4783  hypothetical protein  43.84 
 
 		 336 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000597107  normal  0.813715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  27.04 
 
 		 3689 aa  47.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2566  hypothetical protein  26.9 
 
 		 980 aa  47.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00381829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  31.33 
 
 		 2458 aa  47.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  35.05 
 
 		 955 aa  47.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  34.65 
 
 		 940 aa  47.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  31.4 
 
 		 1834 aa  46.6  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3696  hypothetical protein  40.43 
 
 		 273 aa  46.6  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  39.66 
 
 		 2286 aa  47  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  24.77 
 
 		 2731 aa  47  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  33 
 
 		 1953 aa  46.6  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  28.49 
 
 		 1485 aa  46.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  28.47 
 
 		 1976 aa  46.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  24.37 
 
 		 1595 aa  45.8  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  24.42 
 
 		 1572 aa  46.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  36.63 
 
 		 927 aa  45.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  24.37 
 
 		 1586 aa  45.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  24.56 
 
 		 1614 aa  45.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>