More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0653 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  52.81 
 
 		 936 aa  679    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  52.75 
 
 		 883 aa  637    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0255  translation initiation factor IF-2  60.46 
 
 		 979 aa  843    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0032  translation initiation factor IF-2  64.62 
 
 		 1016 aa  820    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.247962 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  52.34 
 
 		 911 aa  662    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01335  putative translation initiation factor  63.41 
 
 		 943 aa  830    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  44.61 
 
 		 1029 aa  649    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  53.66 
 
 		 882 aa  643    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  53.41 
 
 		 947 aa  643    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  52.5 
 
 		 915 aa  674    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  54.81 
 
 		 1022 aa  673    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  57.96 
 
 		 956 aa  819    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0139  translation initiation factor IF-2  60.51 
 
 		 908 aa  811    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0398  translation initiation factor IF-2  53.12 
 
 		 986 aa  657    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0010836  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0300  translation initiation factor IF-2  54.28 
 
 		 952 aa  661    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0137727  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  53.48 
 
 		 986 aa  637    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  59.08 
 
 		 1008 aa  845    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1215  translation initiation factor IF-2  63.41 
 
 		 1148 aa  801    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  53.83 
 
 		 980 aa  638    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  59.28 
 
 		 924 aa  705    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0653  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 1204 aa  2418    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.696738  normal  0.0609071 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  44.44 
 
 		 985 aa  649    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  62.69 
 
 		 945 aa  848    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  52.26 
 
 		 991 aa  682    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  52.61 
 
 		 884 aa  633  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  47.57 
 
 		 984 aa  634  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  43.67 
 
 		 1079 aa  633  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  52.96 
 
 		 732 aa  629  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  51.04 
 
 		 921 aa  632  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  52.96 
 
 		 739 aa  623  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  46.25 
 
 		 971 aa  619  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  52.21 
 
 		 1079 aa  610  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  51.13 
 
 		 907 aa  612  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  44.72 
 
 		 860 aa  604  1.0000000000000001e-171  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  51.72 
 
 		 898 aa  602  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  49.91 
 
 		 892 aa  602  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  49.49 
 
 		 997 aa  601  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  48.18 
 
 		 896 aa  598  1e-169  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  52.05 
 
 		 968 aa  599  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  51.39 
 
 		 692 aa  598  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  50.92 
 
 		 689 aa  599  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4067  translation initiation factor IF-2  46.7 
 
 		 917 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  51.28 
 
 		 686 aa  595  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  51.28 
 
 		 686 aa  594  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  51.11 
 
 		 686 aa  594  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  51.11 
 
 		 686 aa  594  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  48.61 
 
 		 822 aa  593  1e-168  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  51.45 
 
 		 688 aa  595  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  51.28 
 
 		 686 aa  594  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  51.11 
 
 		 686 aa  594  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  51.28 
 
 		 686 aa  595  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  50.6 
 
 		 720 aa  592  1e-167  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  47.23 
 
 		 959 aa  592  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  50.68 
 
 		 688 aa  589  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  48.62 
 
 		 903 aa  591  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  50.52 
 
 		 894 aa  590  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  43.26 
 
 		 882 aa  590  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4387  translation initiation factor IF-2  46.54 
 
 		 917 aa  589  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.582492 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0831  translation initiation factor IF-2  39.88 
 
 		 882 aa  592  1e-167  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.857351  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  49.58 
 
 		 885 aa  588  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  41.17 
 
 		 1161 aa  587  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  49.75 
 
 		 885 aa  588  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  49.75 
 
 		 885 aa  588  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  47.23 
 
 		 990 aa  588  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  50.09 
 
 		 752 aa  588  1e-166  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  47.49 
 
 		 885 aa  587  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 		 889 aa  588  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  51.74 
 
 		 845 aa  588  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  47.73 
 
 		 848 aa  589  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1247  translation initiation factor IF-2  50.69 
 
 		 943 aa  587  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182707  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  51.38 
 
 		 922 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  51.03 
 
 		 992 aa  584  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  49.41 
 
 		 880 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  52.14 
 
 		 964 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  47.86 
 
 		 835 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  50.52 
 
 		 943 aa  585  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 		 885 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  49.07 
 
 		 880 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  45.76 
 
 		 964 aa  580  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  50.6 
 
 		 705 aa  581  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  47.87 
 
 		 920 aa  582  1e-164  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  49.07 
 
 		 880 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  50.69 
 
 		 904 aa  580  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  50.69 
 
 		 902 aa  582  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 891 aa  581  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  50.6 
 
 		 705 aa  581  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  49.83 
 
 		 943 aa  582  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  49.07 
 
 		 884 aa  580  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  49.07 
 
 		 880 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  52.14 
 
 		 964 aa  581  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  49.07 
 
 		 880 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  48.14 
 
 		 881 aa  580  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  49.07 
 
 		 882 aa  580  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  50.26 
 
 		 686 aa  578  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  50.26 
 
 		 948 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2134  translation initiation factor IF-2  51.72 
 
 		 978 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149988  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  50.86 
 
 		 968 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  51.71 
 
 		 989 aa  579  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  51.54 
 
 		 979 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  49.49 
 
 		 894 aa  579  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>