More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0236 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  100 
 
 		 285 aa  588  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  65.61 
 
 		 285 aa  397  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  59.11 
 
 		 286 aa  301  1e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  49.82 
 
 		 293 aa  268  1e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  41.33 
 
 		 283 aa  203  3e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  42.36 
 
 		 294 aa  187  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  40.36 
 
 		 306 aa  180  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  40.97 
 
 		 312 aa  179  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  38.56 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  37.13 
 
 		 271 aa  139  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  34.55 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  34.96 
 
 		 275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  33.74 
 
 		 275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  33.74 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  34.05 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  34.05 
 
 		 282 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  41.34 
 
 		 282 aa  133  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  32.75 
 
 		 274 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  31.82 
 
 		 280 aa  132  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  32.39 
 
 		 274 aa  132  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  32.76 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  35.53 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  36.92 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  34.18 
 
 		 277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  30.88 
 
 		 336 aa  126  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  37.21 
 
 		 336 aa  125  6e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  40.76 
 
 		 273 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  36.11 
 
 		 290 aa  125  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  40.12 
 
 		 313 aa  122  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  34.55 
 
 		 280 aa  122  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  40.79 
 
 		 285 aa  122  6e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  34.15 
 
 		 331 aa  122  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  37.44 
 
 		 278 aa  122  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  34.26 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  35.38 
 
 		 322 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  40.79 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  32.21 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  33.18 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  34.04 
 
 		 303 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  35.35 
 
 		 281 aa  118  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  37.19 
 
 		 299 aa  116  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  34.42 
 
 		 296 aa  116  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  37.79 
 
 		 296 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  37.79 
 
 		 263 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  32.44 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  36.06 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  36.14 
 
 		 276 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  46.83 
 
 		 141 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  39.1 
 
 		 284 aa  112  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  43.15 
 
 		 363 aa  111  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  31.06 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  33.33 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  32.59 
 
 		 302 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  36.47 
 
 		 375 aa  108  9.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  33.17 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  38.92 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2646  peptidase M23B  35.71 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  29.79 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  45.04 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2531  peptidase M23B  35.71 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1820  Peptidase M23  40.4 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0518424  normal  0.297584 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2423  peptidase M23B  35.71 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  39.56 
 
 		 374 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2214  peptidase M23B  36.22 
 
 		 301 aa  106  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.558528 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  31.39 
 
 		 282 aa  106  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  41.22 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2189  M23/M37 peptidase domain-containing protein  40.28 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  36.94 
 
 		 232 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  36.18 
 
 		 395 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  31.02 
 
 		 287 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2290  peptidase M23B  35.71 
 
 		 306 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0178936  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  42.4 
 
 		 402 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2524  peptidase M23B  35.2 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1560  M24/M37 family peptidase  37.72 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275823  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  34.9 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  30.3 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  37.35 
 
 		 375 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  40 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  33.64 
 
 		 286 aa  102  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  40.88 
 
 		 377 aa  102  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  41.22 
 
 		 243 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  37.66 
 
 		 374 aa  102  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  32.54 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  39.39 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2285  peptidase M23B  33.67 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00385492  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.51 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  40.62 
 
 		 413 aa  101  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  41.6 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1776  Peptidase M23  35.5 
 
 		 434 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  36.31 
 
 		 404 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  40 
 
 		 404 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  30.04 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  35.03 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0630  peptidase M23B  35.88 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0558086 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  31.6 
 
 		 273 aa  100  4e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  40.46 
 
 		 238 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.55 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3376  peptidase M23B  32.26 
 
 		 269 aa  99.8  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  39.13 
 
 		 316 aa  99.4  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  37.06 
 
 		 376 aa  99  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>