More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0334 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0334  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 825 aa  1691    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00715  DNA topoisomerase I  64.14 
 
 		 841 aa  1099    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0754  DNA topoisomerase I  53.57 
 
 		 788 aa  756    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2030  DNA topoisomerase I  54.01 
 
 		 894 aa  867    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0825092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2189  DNA topoisomerase I  58.67 
 
 		 857 aa  963    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.824425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1955  DNA topoisomerase I  55.63 
 
 		 784 aa  796    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.3591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1150  hypothetical protein  51.37 
 
 		 780 aa  759    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0196  DNA topoisomerase  53.33 
 
 		 835 aa  768    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2343  DNA topoisomerase I  55.09 
 
 		 841 aa  792    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.767533 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1851  DNA topoisomerase I  67.21 
 
 		 839 aa  1097    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1210  DNA topoisomerase I  56.12 
 
 		 792 aa  819    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00167448  hitchhiker  0.000869825 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2326  DNA topoisomerase I  43.91 
 
 		 799 aa  615  1e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.240337  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0191  DNA topoisomerase I  44.61 
 
 		 823 aa  611  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3010  DNA topoisomerase I  43.95 
 
 		 783 aa  599  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.846821  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2632  DNA topoisomerase I  43.9 
 
 		 797 aa  598  1e-169  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.080388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2277  DNA topoisomerase I  43.09 
 
 		 854 aa  591  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0137658 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3591  DNA topoisomerase I  43.13 
 
 		 824 aa  583  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.405231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2090  DNA topoisomerase I  42.54 
 
 		 834 aa  582  1e-164  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475207  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1934  DNA topoisomerase I  42.48 
 
 		 815 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1869  DNA topoisomerase I  43.7 
 
 		 815 aa  575  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04049  DNA topoisomerase I  42.3 
 
 		 830 aa  567  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0309  DNA topoisomerase I  39.71 
 
 		 1023 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130268  normal  0.23063 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2316  DNA topoisomerase I  39.19 
 
 		 880 aa  535  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1354  DNA topoisomerase I  38.19 
 
 		 849 aa  529  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.75959  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  45.2 
 
 		 757 aa  526  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4305  DNA topoisomerase I  39.08 
 
 		 1049 aa  528  1e-148  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0227  DNA topoisomerase I  40.46 
 
 		 845 aa  527  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0428468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3671  DNA topoisomerase I  39.01 
 
 		 885 aa  527  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  44.7 
 
 		 710 aa  522  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  44.75 
 
 		 711 aa  524  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3202  DNA topoisomerase I  36.91 
 
 		 915 aa  524  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3914  DNA topoisomerase I  38.59 
 
 		 901 aa  525  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0659  DNA topoisomerase I  37.47 
 
 		 851 aa  524  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579537  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0816  DNA topoisomerase I  44.97 
 
 		 689 aa  519  1e-146  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.996687  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0604  DNA topoisomerase I  38.45 
 
 		 877 aa  520  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1387  DNA topoisomerase I  37.57 
 
 		 884 aa  521  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903307  normal  0.17492 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  44.34 
 
 		 756 aa  521  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1756  DNA topoisomerase I  37.4 
 
 		 904 aa  522  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1972  DNA topoisomerase I  39.18 
 
 		 898 aa  522  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  44.65 
 
 		 758 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0850  DNA topoisomerase I  38.68 
 
 		 884 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.999873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2001  DNA topoisomerase I  37.68 
 
 		 964 aa  516  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2339  DNA topoisomerase I  36.93 
 
 		 893 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.786994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1295  DNA topoisomerase I  37.2 
 
 		 884 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722616  decreased coverage  0.00167989 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  44.74 
 
 		 783 aa  516  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0528  DNA topoisomerase I  43.53 
 
 		 776 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000697651  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  45.51 
 
 		 691 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2178  DNA topoisomerase I  38.68 
 
 		 884 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3847  DNA topoisomerase I  36.44 
 
 		 977 aa  513  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0674028 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2197  DNA topoisomerase I  37.74 
 
 		 923 aa  513  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.777958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  44.67 
 
 		 758 aa  512  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3355  DNA topoisomerase I  38.96 
 
 		 911 aa  512  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0569  DNA topoisomerase I  38.11 
 
 		 877 aa  512  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  45.73 
 
 		 841 aa  512  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4350  DNA topoisomerase I  37.77 
 
 		 913 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.350571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3631  DNA topoisomerase I  38.5 
 
 		 910 aa  509  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.391987 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2831  DNA topoisomerase I  36.89 
 
 		 894 aa  512  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442826 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1282  DNA topoisomerase I  36.69 
 
 		 867 aa  510  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390974  normal  0.233625 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0932  DNA topoisomerase I  37.87 
 
 		 914 aa  511  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231933  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  44.81 
 
 		 691 aa  508  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3308  DNA topoisomerase I  38.38 
 
 		 910 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.603325 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  44.81 
 
 		 691 aa  508  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1416  DNA topoisomerase I  39.46 
 
 		 883 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1137  DNA topoisomerase I  36.5 
 
 		 900 aa  507  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  44.08 
 
 		 697 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2200  DNA topoisomerase I  37.03 
 
 		 895 aa  503  1e-141  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.170187  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9223  DNA topoisomerase  37.95 
 
 		 883 aa  503  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  44.51 
 
 		 779 aa  503  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3160  DNA topoisomerase I  36.02 
 
 		 907 aa  504  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.973259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1995  DNA topoisomerase I  45.35 
 
 		 691 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0344  DNA topoisomerase I  37.1 
 
 		 924 aa  503  1e-141  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0729  DNA topoisomerase I  36.07 
 
 		 891 aa  504  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.074453  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  44.57 
 
 		 692 aa  502  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3684  DNA topoisomerase I  44.25 
 
 		 692 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0116868  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  44.41 
 
 		 692 aa  501  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000026995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  44.25 
 
 		 692 aa  501  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2784  DNA topoisomerase I  37.92 
 
 		 906 aa  500  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3656  DNA topoisomerase I  44.72 
 
 		 692 aa  499  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  44.25 
 
 		 692 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000571341  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3309  DNA topoisomerase I  37.05 
 
 		 888 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3417  DNA topoisomerase I  36.37 
 
 		 961 aa  500  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0414891  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  44.25 
 
 		 692 aa  501  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  44.07 
 
 		 779 aa  499  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3508  DNA topoisomerase I  38.11 
 
 		 909 aa  502  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.989959 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1312  DNA topoisomerase I  44.25 
 
 		 692 aa  497  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000876522  unclonable  7.60195e-25 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  42.8 
 
 		 768 aa  498  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3875  DNA topoisomerase I  44.41 
 
 		 692 aa  496  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000221974  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1005  DNA topoisomerase I  36.87 
 
 		 894 aa  496  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.387965  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3931  DNA topoisomerase I  44.25 
 
 		 692 aa  496  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000332787  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1211  DNA topoisomerase I  36.51 
 
 		 849 aa  496  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5396  DNA topoisomerase I  37.3 
 
 		 955 aa  496  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.585871  normal  0.0823046 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3880  DNA topoisomerase I  44.25 
 
 		 692 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000115411  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1133  DNA topoisomerase I  37.34 
 
 		 816 aa  493  9.999999999999999e-139  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  44.85 
 
 		 836 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  46.37 
 
 		 780 aa  495  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3149  DNA topoisomerase I  37.21 
 
 		 912 aa  495  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1505  DNA topoisomerase I  36.72 
 
 		 896 aa  494  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  44.46 
 
 		 697 aa  494  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  45.01 
 
 		 702 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1803  DNA topoisomerase I  37.57 
 
 		 859 aa  494  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.120095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>