101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0898 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0898  cytidylate kinase  100 
 
 
181 aa  358  2e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.136521  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1109  cytidylate kinase  51.69 
 
 
184 aa  184  4e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1364  cytidylate kinase  49.44 
 
 
184 aa  179  1e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.790143  normal  0.0224769 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1729  cytidylate kinase  46.63 
 
 
184 aa  170  7.999999999999999e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000578527 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0399  cytidylate kinase  52.81 
 
 
184 aa  164  9e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185017  normal  0.222549 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0626  cytidylate kinase  43.58 
 
 
187 aa  156  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1703  cytidylate kinase  44.85 
 
 
172 aa  137  7e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.784294  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1751  cytidylate kinase  42.53 
 
 
189 aa  136  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0118  cytidylate kinase  41.21 
 
 
180 aa  134  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000087822  hitchhiker  0.0000442728 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1734  cytidylate kinase  41.94 
 
 
192 aa  122  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165208 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1813  cytidylate kinase  38.55 
 
 
192 aa  119  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.147241  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0107  cytidylate kinase  37.93 
 
 
177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.233857  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2321  cytidylate kinase  39.16 
 
 
192 aa  117  9e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1127  cytidylate kinase  36.6 
 
 
178 aa  115  5e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.402231  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2255  cytidylate kinase  36.75 
 
 
191 aa  114  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1495  cytidylate kinase  37.13 
 
 
179 aa  114  5e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0979  cytidylate kinase  36.6 
 
 
178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0270  cytidylate kinase  36.09 
 
 
191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1649  cytidylate kinase  35.95 
 
 
178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.73903  normal  0.997406 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1499  cytidylate kinase  38.73 
 
 
174 aa  112  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0265  cytidylate kinase  35.95 
 
 
178 aa  111  5e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0083  cytidylate kinase  38.32 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396405  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0027  cytidylate kinase  40.65 
 
 
175 aa  107  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000301148  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0468  cytidylate kinase  38.85 
 
 
176 aa  107  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0590  cytidylate kinase  38.75 
 
 
181 aa  105  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0558  cytidylate kinase  32.94 
 
 
182 aa  99.4  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.818814  normal  0.184695 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2227  cytidylate kinase  35.43 
 
 
178 aa  98.6  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0849  cytidylate kinase  34.52 
 
 
180 aa  95.5  4e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1254  cytidylate kinase  34.91 
 
 
204 aa  95.1  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1945  cytidylate kinase  33.54 
 
 
203 aa  90.9  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1087  cytidylate kinase  35.53 
 
 
187 aa  84.7  7e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1866  hypothetical protein  30.73 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.546086  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1859  hypothetical protein  30.9 
 
 
327 aa  82  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546809  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0405  cytidylate kinase  27.72 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  28.84 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3839  cytidylate kinase-like protein  26.09 
 
 
251 aa  63.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.206028  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0348  cytidylate kinase  27.07 
 
 
237 aa  53.9  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000112286  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0417  cytidylate kinase  27.95 
 
 
237 aa  51.2  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000354402  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1351  cytidylate kinase  25.11 
 
 
220 aa  51.2  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0401638  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0594  cytidylate kinase  61.11 
 
 
213 aa  50.8  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2381  cytidylate kinase-like  25.58 
 
 
242 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0882495 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  24.65 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  34.94 
 
 
228 aa  49.7  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0086  cytidylate kinase  27.31 
 
 
234 aa  48.9  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  25 
 
 
230 aa  49.3  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  27.84 
 
 
514 aa  49.3  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1733  cytidylate kinase  27.52 
 
 
238 aa  48.9  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000909322  hitchhiker  0.0092352 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  26.23 
 
 
218 aa  48.9  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  23.65 
 
 
204 aa  48.9  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  26.49 
 
 
233 aa  48.5  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1507  cytidylate kinase  25.47 
 
 
209 aa  47.8  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000128864  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2398  response regulator receiver protein  25.14 
 
 
271 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  28.88 
 
 
229 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4424  cytidylate kinase  24.64 
 
 
225 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0499  cytidylate kinase  43.55 
 
 
220 aa  46.2  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0933266  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1920  cytidylate kinase  23.3 
 
 
226 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011282 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1668  cytidylate kinase  29.57 
 
 
230 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2334  cytidylate kinase  32.61 
 
 
226 aa  46.2  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000116453  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0478  cytidylate kinase  26.7 
 
 
207 aa  45.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  24.56 
 
 
217 aa  45.4  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1309  cytidylate kinase  57.89 
 
 
215 aa  45.4  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000117223 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  21.97 
 
 
227 aa  45.1  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  42.86 
 
 
214 aa  44.7  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  50 
 
 
233 aa  44.7  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  37.5 
 
 
226 aa  44.3  0.0009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  55.56 
 
 
229 aa  44.3  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  23.48 
 
 
255 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0030  cytidylate kinase  27.7 
 
 
212 aa  44.3  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5059  cytidylate kinase  24.19 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373389  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  24.89 
 
 
230 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0128  cytidylate kinase  38.33 
 
 
221 aa  44.3  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  23.03 
 
 
218 aa  43.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3284  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  25.82 
 
 
679 aa  43.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.185076  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3123  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  49.06 
 
 
705 aa  43.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.921195  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  39.77 
 
 
219 aa  43.5  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  23.33 
 
 
226 aa  43.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  40 
 
 
232 aa  43.5  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  42.11 
 
 
231 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  24.06 
 
 
214 aa  43.5  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  30.84 
 
 
225 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0908  cytidylate kinase  55.26 
 
 
230 aa  42.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  50 
 
 
232 aa  42.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0099  cytidylate kinase  24.05 
 
 
208 aa  42.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.906806 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  50 
 
 
222 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3142  cytidylate kinase  32.22 
 
 
229 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00253738  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0451  cytidylate kinase  51.35 
 
 
231 aa  42.4  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.001027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  34.41 
 
 
229 aa  42  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  44.74 
 
 
240 aa  42  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  37.5 
 
 
230 aa  42  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  24.55 
 
 
225 aa  42  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3784  cytidylate kinase  40.68 
 
 
194 aa  42  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150684  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0594  adenylate kinase  33.33 
 
 
167 aa  42  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  22.16 
 
 
232 aa  42  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf302  cytidylate kinase  24.22 
 
 
223 aa  42  0.005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.245847  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15860  cytidylate kinase  33.61 
 
 
229 aa  41.6  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  28 
 
 
224 aa  41.6  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  22.28 
 
 
201 aa  41.6  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  42.11 
 
 
228 aa  41.6  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  34.41 
 
 
229 aa  41.2  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0508  cytidylate kinase  44.74 
 
 
221 aa  41.2  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>