More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0499 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0499  cytidylate kinase  100 
 
 		 220 aa  435  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0933266  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1309  cytidylate kinase  92.56 
 
 		 215 aa  370  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000117223 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  61.5 
 
 		 226 aa  265  4e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  61.5 
 
 		 226 aa  265  4e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2570  cytidylate kinase  60.47 
 
 		 221 aa  257  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138254  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1790  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  58.14 
 
 		 668 aa  256  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149687 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4159  cytidylate kinase  62.91 
 
 		 228 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0721  cytidylate kinase  60 
 
 		 219 aa  256  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0824528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0567  cytidylate kinase  62.91 
 
 		 228 aa  255  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1046  cytidylate kinase  62.91 
 
 		 228 aa  255  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1005  cytidylate kinase  62.91 
 
 		 228 aa  255  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1637  cytidylate kinase  62.26 
 
 		 228 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2883  cytidylate kinase  62.26 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0880838  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2468  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  58.8 
 
 		 673 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.835531  normal  0.361895 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2946  cytidylate kinase  62.26 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2995  cytidylate kinase  62.26 
 
 		 255 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1392  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  58.33 
 
 		 673 aa  251  5.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121243  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2573  cytidylate kinase  61.79 
 
 		 228 aa  251  6e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0883038  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0200  cytidylate kinase  61.79 
 
 		 228 aa  251  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0429  cytidylate kinase  61.79 
 
 		 228 aa  251  6e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0948  cytidylate kinase  61.79 
 
 		 228 aa  251  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0745  cytidylate kinase  60.93 
 
 		 228 aa  250  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.804624  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0908  cytidylate kinase  57.87 
 
 		 230 aa  244  8e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0981  cytidylate kinase  60 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3002  cytidylate kinase  60.47 
 
 		 228 aa  242  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  hitchhiker  0.00995031 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3284  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  57.21 
 
 		 679 aa  240  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.185076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1567  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  57.6 
 
 		 669 aa  239  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.484392  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0849  cytidylate kinase  58.02 
 
 		 231 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.744629  normal  0.265979 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0778  cytidylate kinase  58.02 
 
 		 231 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00825892 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2795  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  53.92 
 
 		 667 aa  238  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233138 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0922  cytidylate kinase  62.91 
 
 		 228 aa  238  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0926  cytidylate kinase  62.44 
 
 		 228 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.293692 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2258  cytidylate kinase  61.97 
 
 		 228 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3123  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  54.88 
 
 		 705 aa  234  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.921195  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2070  cytidylate kinase  59.43 
 
 		 229 aa  231  7.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000348998  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1615  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  55.35 
 
 		 670 aa  229  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4723  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  54.17 
 
 		 675 aa  223  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.86018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2243  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  51.87 
 
 		 674 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0963  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  53.74 
 
 		 699 aa  220  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  52.07 
 
 		 229 aa  218  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3036  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  55.87 
 
 		 653 aa  217  8.999999999999998e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00127659  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0955  cytidylate kinase  57.07 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000242866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  51.85 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1279  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  58.06 
 
 		 643 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.091835  normal  0.851498 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  52.4 
 
 		 221 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  49.31 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  52.8 
 
 		 229 aa  207  8e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1332  cytidylate kinase  50.23 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000433479  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  51.87 
 
 		 229 aa  204  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  50.47 
 
 		 229 aa  202  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  50.46 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  50.46 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  50.7 
 
 		 225 aa  201  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  50.46 
 
 		 228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2856  cytidylate kinase  51.17 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000021992  hitchhiker  0.0000000124191 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  48.6 
 
 		 232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1645  cytidylate kinase  48.36 
 
 		 225 aa  198  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1375  cytidylate kinase  46.76 
 
 		 230 aa  198  6e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1371  cytidylate kinase  46.76 
 
 		 230 aa  198  6e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2334  cytidylate kinase  46.3 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000116453  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15860  cytidylate kinase  51.6 
 
 		 229 aa  194  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  48.58 
 
 		 227 aa  194  7e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  44.84 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  43.5 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  48.61 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  47.89 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  51.64 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02861  cytidylate kinase  44.84 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1026  cytidylate kinase  47.87 
 
 		 226 aa  191  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000434199  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2403  cytidylate kinase  43.69 
 
 		 230 aa  191  8e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  43.69 
 
 		 230 aa  190  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  44.8 
 
 		 229 aa  190  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  43.95 
 
 		 227 aa  189  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  45.25 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  43.69 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  43.69 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  44.89 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  44.89 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  44.89 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  44.89 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  44.89 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2669  cytidylate kinase  43.56 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410063  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  43.56 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000903512  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2581  cytidylate kinase  43.56 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000568011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  44.89 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  44.89 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  44.89 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  44.89 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  42.34 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  44.59 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  46.86 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0254  cytidylate kinase  44.24 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.13077  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  48.11 
 
 		 224 aa  185  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  44 
 
 		 227 aa  184  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  44 
 
 		 227 aa  184  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  44 
 
 		 227 aa  184  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  44 
 
 		 227 aa  184  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  44 
 
 		 227 aa  184  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  42.79 
 
 		 230 aa  184  8e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>