More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1019 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1019  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 572 aa  1170    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.463707  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1278  TonB-dependent receptor  52.11 
 
 		 571 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.354768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1260  TonB-dependent receptor  36.09 
 
 		 581 aa  345  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 634 aa  115  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3667  TonB-dependent receptor plug  23.99 
 
 		 624 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 618 aa  110  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0444  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 667 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1228  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 623 aa  104  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0002097  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  23.22 
 
 		 671 aa  101  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 602 aa  98.6  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 626 aa  97.1  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  23.89 
 
 		 634 aa  97.1  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 626 aa  96.7  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 593 aa  89.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  24.11 
 
 		 623 aa  87.4  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4645  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 693 aa  87.4  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318415 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 613 aa  87  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 624 aa  85.1  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1445  TonB-dependent receptor, putative  24.64 
 
 		 593 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  23 
 
 		 620 aa  84.7  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  24.47 
 
 		 661 aa  84  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  21.93 
 
 		 683 aa  82.8  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 612 aa  81.3  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 		 705 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.45 
 
 		 614 aa  80.5  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.45 
 
 		 614 aa  80.1  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.45 
 
 		 614 aa  80.1  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.45 
 
 		 614 aa  80.5  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 697 aa  79.7  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.5 
 
 		 623 aa  80.1  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  33.74 
 
 		 713 aa  79.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.45 
 
 		 614 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 640 aa  78.6  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  23.31 
 
 		 668 aa  77.8  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  29.69 
 
 		 653 aa  77  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  23.36 
 
 		 628 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  24.33 
 
 		 614 aa  75.5  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  24.7 
 
 		 617 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  31.55 
 
 		 642 aa  75.5  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 642 aa  75.1  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.62 
 
 		 614 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2063  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 645 aa  74.3  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.785465  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4967  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 698 aa  73.9  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3220  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 654 aa  73.9  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.45 
 
 		 614 aa  73.6  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.45 
 
 		 614 aa  73.6  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.45 
 
 		 614 aa  73.6  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.89 
 
 		 614 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.45 
 
 		 614 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 709 aa  73.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 647 aa  73.2  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  22.63 
 
 		 680 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 637 aa  72.8  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4821  TonB-dependent receptor  21.24 
 
 		 621 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  23.48 
 
 		 634 aa  72.4  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52120  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 668 aa  72.4  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.618776  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  22.74 
 
 		 615 aa  72.8  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3315  TonB-dependent receptor plug  25.16 
 
 		 650 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0028  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 641 aa  71.6  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2735  TonB-dependent receptor, plug  31.9 
 
 		 650 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0252  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 663 aa  70.9  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.945527  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.44 
 
 		 615 aa  70.9  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  22.46 
 
 		 662 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 680 aa  70.5  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  30.68 
 
 		 690 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2675  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 667 aa  69.7  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 643 aa  69.7  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  22.28 
 
 		 662 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 664 aa  69.3  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 624 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  22.28 
 
 		 662 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  25.25 
 
 		 611 aa  68.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  23.74 
 
 		 597 aa  68.6  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 652 aa  68.2  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1952  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 656 aa  67.4  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446334  normal  0.0364758 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.09 
 
 		 615 aa  67.4  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 688 aa  67  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 690 aa  67  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  21.57 
 
 		 674 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  23.87 
 
 		 639 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  26.39 
 
 		 627 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  21.78 
 
 		 665 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3545  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 666 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 651 aa  65.5  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  22.24 
 
 		 695 aa  65.5  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0151  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  32.28 
 
 		 675 aa  64.3  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 701 aa  64.3  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 		 686 aa  63.9  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 642 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0576  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 		 621 aa  63.5  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 634 aa  63.5  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3157  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 714 aa  63.5  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  24.18 
 
 		 628 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1989  TonB-dependent receptor  20.85 
 
 		 675 aa  63.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000419445  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4414  TonB-dependent receptor plug  21.93 
 
 		 639 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  22.35 
 
 		 695 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  21.88 
 
 		 653 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1786  TonB-dependent heme receptor  28.49 
 
 		 718 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 678 aa  62.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1191  TonB-dependent receptor  22.52 
 
 		 744 aa  62.4  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.601925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>